39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002380 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002380  MSHA biogenesis protein MshO  100 
 
 		 253 aa  518  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.197407  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03688  hypothetical protein  48.82 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0480  exported protein MshO  33.46 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.772217  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0180  prepilin-type cleavage/methylation  28.21 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0400  methylation site containing protein  28.36 
 
 		 265 aa  99.8  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.642203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0555  methylation site containing protein  27.94 
 
 		 269 aa  98.6  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0166475  normal  0.583012 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3825  MSHA biogenesis protein MshO  30.14 
 
 		 282 aa  98.6  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0143391  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4405  methylation site containing protein  27.54 
 
 		 277 aa  95.1  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0476  methylation site containing protein  28.72 
 
 		 287 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0553768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3475  methylation site containing protein  27.08 
 
 		 287 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3651  methylation site containing protein  27.44 
 
 		 287 aa  92.8  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0494  MSHA biogenesis protein MshO  28.57 
 
 		 282 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709841  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0519  MSHA biogenesis protein MshO  29.43 
 
 		 282 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3757  methylation site containing protein  26.79 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4102  MSHA biogenesis protein MshO  28.88 
 
 		 282 aa  88.6  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0515  MSHA biogenesis protein MshO  28.92 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.141751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0571  MSHA biogenesis protein MshO  27.86 
 
 		 281 aa  87  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3337  MSHA biogenesis protein MshO precursor  27.7 
 
 		 278 aa  85.9  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.131781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00261  Tfp pilus assembly protein PilW  27.56 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2830  hypothetical protein  37.6 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.496531  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3741  methylation site containing protein  28.93 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.772407  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4566  putative MSHA biogenesis protein MshO  25.78 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3104  hypothetical protein  37.37 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0464  MSHA biogenesis protein MshO precursor  23 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.467537  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3339  methylation  38.54 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.510017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0763  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0696342  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3265  type II secretory pathway pseudopilin PulG  27.34 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0394  type II secretory pathway pseudopilin PulG  26.45 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0757  hypothetical protein  29.63 
 
 		 261 aa  52  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.538658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1144  MSHA biogenesis protein MshO  31.46 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0859  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  39.34 
 
 		 212 aa  46.2  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0017  hypothetical protein  29.35 
 
 		 343 aa  45.8  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1414  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1292 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4845  type IV pilus assembly protein PilW  38.6 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  32.05 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  32.05 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0212  type IV pilus assembly protein PilW  35 
 
 		 344 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.041624 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0886  general secretion pathway protein H  34.44 
 
 		 283 aa  42.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.115142 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  29.41 
 
 		 157 aa  42  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>