64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3183 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  100 
 
 		 157 aa  314  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2536  type IV pilus modification protein PilV  86.61 
 
 		 237 aa  224  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5194  type IV pilus modification protein PilV  58.33 
 
 		 210 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.524323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5188  type IV pilus modification protein PilV  46.15 
 
 		 206 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2910  type IV pilus modification protein PilV  41.94 
 
 		 192 aa  89.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389723  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3828  type IV pilus modification protein PilV  37.98 
 
 		 215 aa  87.4  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  40.31 
 
 		 219 aa  87  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3106  type IV pilus modification protein PilV  41.27 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0668  hypothetical protein  31.25 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  31.82 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  32.8 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0685  hypothetical protein  30.47 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1291  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV transmembrane protein  33.59 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  31.3 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0727  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV-related transmembrane protein  32.09 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.698407 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0671  type IV pilus modification protein PilV  30.37 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2886  type IV pilus modification protein PilV  22.05 
 
 		 182 aa  57  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.313421  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0189  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein PilV  30.71 
 
 		 180 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2914  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  34.35 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1103  type IV pilus modification protein PilV  28.18 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1063  type IV pilus modification protein PilV  29.91 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  30.63 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  31.2 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2881  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  32.43 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0714  type IV pilus modification protein PilV  29.63 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5183  type IV pilus modification protein PilV  31.25 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0958149  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  29.84 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  31.15 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3132  type IV pilus modification protein PilV  26.79 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  32.54 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1058  type IV pilus modification protein PilV  28.95 
 
 		 195 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1160  type IV pilus modification protein PilV  29.82 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.574429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2953  type IV pilus modification protein PilV  28.57 
 
 		 188 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.192573  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0234  type IV fimbrial biogenesis protein PilV  28.89 
 
 		 216 aa  52  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3231  type IV pilus modification protein PilV  28.95 
 
 		 195 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3035  type IV pilus modification protein PilV  27.19 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  26.72 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1125  type IV pilus modification protein PilV  28.95 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0784  hypothetical protein  30.41 
 
 		 194 aa  51.6  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03026  hypothetical protein  29.41 
 
 		 220 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3528  hypothetical protein  28.07 
 
 		 187 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  35.23 
 
 		 225 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2822  type IV pilus modification protein PilV  37.84 
 
 		 223 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5686  Type IV fimbrial biogenesis, pilV-related transmembrane protein  31.67 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1295  type IV pilus modification protein PilV  23.28 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.444338 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  32.41 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  24.43 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1213  type IV pilus modification protein PilV  30.36 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  33.82 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2023  hypothetical protein  37.5 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3174  hypothetical protein  25.58 
 
 		 191 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  31.82 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2719  methylation  23.08 
 
 		 184 aa  43.9  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0213  type IV pilus modification protein PilV  30.89 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.035208 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3168  type IV pilus modification protein PilV  35.09 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0854  type IV pilus modification protein PilV  35.09 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0486  methylation  33.93 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0016  type IV pilus modification protein PilV  40 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2678  type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  29.75 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3405  fimbrial biogenesis protein  47.62 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11840  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilV-like protein  33.33 
 
 		 177 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002380  MSHA biogenesis protein MshO  29.41 
 
 		 253 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.197407  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2838  type IV pilus modification protein PilV  36.36 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0708061  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2665  type IV pilus modification protein PilV  25.6 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>