69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1379 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  100 
 
 		 165 aa  334  2.9999999999999997e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01321  type IV pilus modification protein PilV  55.17 
 
 		 138 aa  153  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1706  type IV pilus modification protein PilV  46.36 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1768  putative type IV pilus assembly protein PilV  46.36 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  37.41 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  35.84 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0016  type IV pilus modification protein PilV  34.31 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  55 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  40.98 
 
 		 225 aa  57.8  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  50 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  35.85 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  26.81 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  30 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  43.33 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2886  type IV pilus modification protein PilV  35.71 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.313421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3132  type IV pilus modification protein PilV  40.45 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2822  type IV pilus modification protein PilV  43.28 
 
 		 223 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0213  type IV pilus modification protein PilV  29.66 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.035208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  49.09 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  40.51 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  32.41 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0854  type IV pilus modification protein PilV  47.27 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3168  type IV pilus modification protein PilV  47.27 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0020  type IV pilus modification protein PilV  41.27 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.908433  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0024  pre-pilin leader sequence  41.27 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  37.5 
 
 		 185 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3231  type IV pilus modification protein PilV  30.63 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1103  type IV pilus modification protein PilV  34.34 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0234  type IV fimbrial biogenesis protein PilV  36.08 
 
 		 216 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1295  type IV pilus modification protein PilV  30.14 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.444338 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1160  type IV pilus modification protein PilV  39.73 
 
 		 195 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.574429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2881  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  32.28 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3528  hypothetical protein  45.76 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1125  type IV pilus modification protein PilV  30.38 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1058  type IV pilus modification protein PilV  30 
 
 		 195 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3828  type IV pilus modification protein PilV  37.29 
 
 		 215 aa  48.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3039  hypothetical protein  38.81 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.430738  normal  0.140833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3106  type IV pilus modification protein PilV  37.35 
 
 		 185 aa  47.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0784  hypothetical protein  31.78 
 
 		 194 aa  47.8  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1291  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV transmembrane protein  31.71 
 
 		 179 aa  47.8  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  39.71 
 
 		 219 aa  47.4  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0490  methylation  30.36 
 
 		 152 aa  47.4  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2910  type IV pilus modification protein PilV  29.1 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389723  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  32.41 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3817  putative prepilin peptidase dependent protein c precursor  37.5 
 
 		 113 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630035  normal  0.0912709 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2536  type IV pilus modification protein PilV  30.48 
 
 		 237 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2953  type IV pilus modification protein PilV  44.07 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.192573  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1087  type IV pilus modification protein PilV  38.89 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0685  hypothetical protein  27.33 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2906  hypothetical protein  31.39 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.809421 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3035  type IV pilus modification protein PilV  41.67 
 
 		 186 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1063  type IV pilus modification protein PilV  36.14 
 
 		 183 aa  44.3  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0388  putative type IV pilin  34.57 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5188  type IV pilus modification protein PilV  26.52 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0668  hypothetical protein  26.71 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0486  methylation  38.71 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2719  methylation  33.72 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0727  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV-related transmembrane protein  36.92 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.698407 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2521  hypothetical protein  37.04 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03026  hypothetical protein  43.86 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3164  prepilin-type cleavage/methylation-like  39.58 
 
 		 554 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00552698  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2665  type IV pilus modification protein PilV  29.55 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0970  type IV pilin, putative  29.47 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.42279  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1317  prepilin-type cleavage/methylation-like  36.78 
 
 		 616 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0115658 
 
 
-
 
NC_002936  DET1353  GspI/GspJ family type II secretion system protein  44.12 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0972416  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1213  type IV pilus modification protein PilV  40.68 
 
 		 193 aa  42  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0989  hypothetical protein  28.69 
 
 		 131 aa  41.6  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.670007  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5183  type IV pilus modification protein PilV  37.7 
 
 		 200 aa  41.6  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0958149  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3405  fimbrial biogenesis protein  40.58 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>