63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3554 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  100 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2822  type IV pilus modification protein PilV  51.76 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  42.36 
 
 		 205 aa  158  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  35.26 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0727  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV-related transmembrane protein  28.92 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.698407 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  35.77 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2665  type IV pilus modification protein PilV  32.06 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3106  type IV pilus modification protein PilV  33.61 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  40.98 
 
 		 165 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2536  type IV pilus modification protein PilV  28.29 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  27.56 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  30.33 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  40 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0784  hypothetical protein  26.52 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2910  type IV pilus modification protein PilV  28.16 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389723  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1291  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV transmembrane protein  35.48 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3039  hypothetical protein  48 
 
 		 128 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.430738  normal  0.140833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  40 
 
 		 171 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  30.65 
 
 		 156 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0213  type IV pilus modification protein PilV  36.67 
 
 		 156 aa  51.6  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.035208 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1213  type IV pilus modification protein PilV  32.28 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3828  type IV pilus modification protein PilV  42.62 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  35.23 
 
 		 157 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0388  putative type IV pilin  41.38 
 
 		 125 aa  50.1  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  40.68 
 
 		 155 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  24 
 
 		 186 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1861  hypothetical protein  39.66 
 
 		 880 aa  48.9  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2886  type IV pilus modification protein PilV  34.48 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.313421  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  27.34 
 
 		 177 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3405  fimbrial biogenesis protein  41.67 
 
 		 151 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5188  type IV pilus modification protein PilV  37.29 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5183  type IV pilus modification protein PilV  26.25 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0958149  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  43.64 
 
 		 219 aa  46.2  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3168  type IV pilus modification protein PilV  31.67 
 
 		 138 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2719  methylation  39.29 
 
 		 184 aa  45.8  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1103  type IV pilus modification protein PilV  34.38 
 
 		 173 aa  45.4  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0486  methylation  42.31 
 
 		 139 aa  45.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0854  type IV pilus modification protein PilV  31.67 
 
 		 138 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0668  hypothetical protein  27.5 
 
 		 179 aa  45.8  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2914  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  29.27 
 
 		 198 aa  45.4  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0685  hypothetical protein  27.5 
 
 		 179 aa  45.4  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5686  Type IV fimbrial biogenesis, pilV-related transmembrane protein  36.36 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3035  type IV pilus modification protein PilV  25.62 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0024  pre-pilin leader sequence  29.87 
 
 		 159 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0020  type IV pilus modification protein PilV  31.08 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.908433  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0189  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein PilV  35 
 
 		 180 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0234  type IV fimbrial biogenesis protein PilV  32.73 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2881  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  32.86 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2153  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5194  type IV pilus modification protein PilV  28.95 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.524323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1706  type IV pilus modification protein PilV  35.85 
 
 		 160 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1768  putative type IV pilus assembly protein PilV  35.85 
 
 		 160 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1087  type IV pilus modification protein PilV  32.76 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1063  type IV pilus modification protein PilV  26.77 
 
 		 183 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3132  type IV pilus modification protein PilV  32.26 
 
 		 186 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2953  type IV pilus modification protein PilV  27.17 
 
 		 188 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.192573  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004284  type 4 fimbrial biogenesis protein PilV  33.93 
 
 		 137 aa  42.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4154  hypothetical protein  29.07 
 
 		 183 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1160  type IV pilus modification protein PilV  30.3 
 
 		 195 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.574429 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0393  MshA pilin protein MshD  35.19 
 
 		 149 aa  42  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000144635  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1295  type IV pilus modification protein PilV  34.55 
 
 		 188 aa  41.6  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.444338 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3231  type IV pilus modification protein PilV  33.33 
 
 		 195 aa  41.6  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>