38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5194 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5194  type IV pilus modification protein PilV  100 
 
 		 210 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.524323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2536  type IV pilus modification protein PilV  53.15 
 
 		 237 aa  214  8e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5188  type IV pilus modification protein PilV  45.67 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  58.33 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2910  type IV pilus modification protein PilV  32.8 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389723  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3185  hypothetical protein  47.67 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.747709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3828  type IV pilus modification protein PilV  30.73 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  32 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  34.78 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3106  type IV pilus modification protein PilV  33.33 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  33.33 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  31.43 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  28.86 
 
 		 170 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0685  hypothetical protein  25.71 
 
 		 179 aa  53.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0213  type IV pilus modification protein PilV  37.04 
 
 		 156 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.035208 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  30.08 
 
 		 155 aa  52.8  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0668  hypothetical protein  25 
 
 		 179 aa  51.6  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  25 
 
 		 177 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1103  type IV pilus modification protein PilV  25 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  30.84 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  25.48 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3132  type IV pilus modification protein PilV  25 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0784  hypothetical protein  30.56 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0189  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein PilV  30.33 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  28.57 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1291  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV transmembrane protein  28.81 
 
 		 179 aa  45.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2881  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  36.51 
 
 		 189 aa  45.1  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0727  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV-related transmembrane protein  27.64 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.698407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  28.95 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1063  type IV pilus modification protein PilV  28.87 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01321  type IV pilus modification protein PilV  29.2 
 
 		 138 aa  43.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1058  type IV pilus modification protein PilV  24.65 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5183  type IV pilus modification protein PilV  25.32 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0958149  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2023  hypothetical protein  31.73 
 
 		 180 aa  42.4  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2886  type IV pilus modification protein PilV  24.49 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.313421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2953  type IV pilus modification protein PilV  25.47 
 
 		 188 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.192573  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0714  type IV pilus modification protein PilV  25.74 
 
 		 167 aa  42  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2665  type IV pilus modification protein PilV  25.93 
 
 		 160 aa  41.6  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>