55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2665 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2665  type IV pilus modification protein PilV  100 
 
 		 160 aa  326  8e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2521  hypothetical protein  33.57 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3039  hypothetical protein  59.32 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.430738  normal  0.140833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  32.06 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2822  type IV pilus modification protein PilV  30.33 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2881  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  36.21 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  36.89 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3405  fimbrial biogenesis protein  30.94 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1063  type IV pilus modification protein PilV  31.82 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1103  type IV pilus modification protein PilV  31.15 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  28.03 
 
 		 185 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  29.1 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1213  type IV pilus modification protein PilV  46.43 
 
 		 193 aa  51.2  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  27.13 
 
 		 156 aa  50.8  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1768  putative type IV pilus assembly protein PilV  34.33 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3132  type IV pilus modification protein PilV  44.07 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1706  type IV pilus modification protein PilV  34.33 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  30.83 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2910  type IV pilus modification protein PilV  27.5 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389723  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2906  hypothetical protein  33.82 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.809421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2953  type IV pilus modification protein PilV  44.07 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.192573  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1125  type IV pilus modification protein PilV  30.71 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3231  type IV pilus modification protein PilV  44.64 
 
 		 195 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1160  type IV pilus modification protein PilV  44.64 
 
 		 195 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.574429 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3528  hypothetical protein  44.64 
 
 		 187 aa  47.8  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3035  type IV pilus modification protein PilV  40.68 
 
 		 186 aa  47.4  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1087  type IV pilus modification protein PilV  40.35 
 
 		 186 aa  47.4  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3168  type IV pilus modification protein PilV  25.78 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0854  type IV pilus modification protein PilV  25.78 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  46.15 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2838  type IV pilus modification protein PilV  34.29 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0708061  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1058  type IV pilus modification protein PilV  42.86 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  27.69 
 
 		 186 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5188  type IV pilus modification protein PilV  28.03 
 
 		 206 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  30.28 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0189  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein PilV  31.15 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3106  type IV pilus modification protein PilV  26.71 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03026  hypothetical protein  33.9 
 
 		 220 aa  44.3  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0016  type IV pilus modification protein PilV  29.84 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0490  methylation  30.33 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2886  type IV pilus modification protein PilV  37.5 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.313421  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0727  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV-related transmembrane protein  25.9 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.698407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3828  type IV pilus modification protein PilV  25.69 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0675  hypothetical protein  31.87 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1295  type IV pilus modification protein PilV  38.18 
 
 		 188 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.444338 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  29.55 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5686  Type IV fimbrial biogenesis, pilV-related transmembrane protein  31.58 
 
 		 202 aa  42  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5194  type IV pilus modification protein PilV  25.2 
 
 		 210 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.524323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004284  type 4 fimbrial biogenesis protein PilV  38.78 
 
 		 137 aa  41.6  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  35 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2914  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  34.48 
 
 		 198 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  35.09 
 
 		 219 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0254  pilus assembly protein  42.37 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  25.6 
 
 		 157 aa  40.8  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0234  type IV fimbrial biogenesis protein PilV  54.84 
 
 		 216 aa  40.4  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>