67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1063 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1063  type IV pilus modification protein PilV  100 
 
 		 183 aa  381  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1103  type IV pilus modification protein PilV  68.82 
 
 		 173 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3132  type IV pilus modification protein PilV  62.63 
 
 		 186 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3035  type IV pilus modification protein PilV  61.17 
 
 		 186 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1160  type IV pilus modification protein PilV  60.75 
 
 		 195 aa  226  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.574429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1125  type IV pilus modification protein PilV  61.29 
 
 		 187 aa  225  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3231  type IV pilus modification protein PilV  60.75 
 
 		 195 aa  224  7e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1058  type IV pilus modification protein PilV  60.22 
 
 		 195 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0928  type IV pilus assembly protein PilV  62.43 
 
 		 172 aa  215  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3528  hypothetical protein  57.14 
 
 		 187 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2953  type IV pilus modification protein PilV  56.32 
 
 		 188 aa  210  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.192573  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1198  type IV pilus modification protein PilV  63.74 
 
 		 173 aa  208  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1295  type IV pilus modification protein PilV  55.49 
 
 		 188 aa  195  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.444338 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2719  methylation  56.18 
 
 		 184 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2886  type IV pilus modification protein PilV  51.4 
 
 		 182 aa  184  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.313421  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1087  type IV pilus modification protein PilV  44.32 
 
 		 186 aa  147  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1213  type IV pilus modification protein PilV  34.04 
 
 		 193 aa  97.8  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2881  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  30.13 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  34.04 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  36.27 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  29.05 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5686  Type IV fimbrial biogenesis, pilV-related transmembrane protein  29.95 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  39.45 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2914  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  27.69 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0685  hypothetical protein  29.06 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0668  hypothetical protein  29.06 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0090  type IV fimbrial biogenesis protein PilV, putative  30.41 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.662578  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11840  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilV-like protein  32.62 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3828  type IV pilus modification protein PilV  29.57 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  31.29 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  40.3 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  50.91 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  31.03 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2536  type IV pilus modification protein PilV  27.27 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  29.91 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3106  type IV pilus modification protein PilV  32.12 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5188  type IV pilus modification protein PilV  26.14 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2838  type IV pilus modification protein PilV  28.66 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0708061  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  28.49 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2665  type IV pilus modification protein PilV  31.82 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0401  type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  33.33 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  25 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  33.82 
 
 		 205 aa  52.4  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2678  type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  30.77 
 
 		 196 aa  52  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0727  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV-related transmembrane protein  30.09 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.698407 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  38.03 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0213  type IV pilus modification protein PilV  29.41 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.035208 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0714  type IV pilus modification protein PilV  31.97 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0486  methylation  41.82 
 
 		 139 aa  47.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0784  hypothetical protein  30.48 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0671  type IV pilus modification protein PilV  30.61 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0189  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein PilV  29.09 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0254  pilus assembly protein  45.28 
 
 		 140 aa  44.7  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2910  type IV pilus modification protein PilV  33.64 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389723  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  35 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0854  type IV pilus modification protein PilV  35.09 
 
 		 138 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3168  type IV pilus modification protein PilV  35.09 
 
 		 138 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  36.14 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  26.77 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0020  type IV pilus modification protein PilV  30.3 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.908433  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0024  pre-pilin leader sequence  26.24 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5194  type IV pilus modification protein PilV  28.87 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.524323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2822  type IV pilus modification protein PilV  29.41 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1291  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV transmembrane protein  24.6 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03026  hypothetical protein  32.73 
 
 		 220 aa  41.6  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3039  hypothetical protein  34.48 
 
 		 128 aa  41.2  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.430738  normal  0.140833 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0675  hypothetical protein  30.3 
 
 		 195 aa  41.2  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>