38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0254 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0254  pilus assembly protein  100 
 
 		 140 aa  278  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0486  methylation  37.29 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0854  type IV pilus modification protein PilV  32.58 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3168  type IV pilus modification protein PilV  32.58 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  29.66 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  44.78 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0727  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV-related transmembrane protein  40.98 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.698407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3231  type IV pilus modification protein PilV  41.03 
 
 		 195 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1125  type IV pilus modification protein PilV  41.03 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1160  type IV pilus modification protein PilV  40 
 
 		 195 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.574429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2953  type IV pilus modification protein PilV  48.08 
 
 		 188 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.192573  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1058  type IV pilus modification protein PilV  39.74 
 
 		 195 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3528  hypothetical protein  47.17 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5188  type IV pilus modification protein PilV  39.73 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0488  hypothetical protein  45.45 
 
 		 161 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000470807  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1295  type IV pilus modification protein PilV  44.44 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.444338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3132  type IV pilus modification protein PilV  43.75 
 
 		 186 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1087  type IV pilus modification protein PilV  46.15 
 
 		 186 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1063  type IV pilus modification protein PilV  45.28 
 
 		 183 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  42.31 
 
 		 177 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1103  type IV pilus modification protein PilV  44.23 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3314  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  31.08 
 
 		 132 aa  43.9  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.424514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0708  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  31.08 
 
 		 132 aa  43.9  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3426  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  31.08 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2886  type IV pilus modification protein PilV  43.14 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.313421  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1034  hypothetical protein  43.75 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  38.89 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3035  type IV pilus modification protein PilV  44.23 
 
 		 186 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  34.62 
 
 		 182 aa  41.6  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0675  hypothetical protein  43.14 
 
 		 195 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  38.18 
 
 		 219 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3106  type IV pilus modification protein PilV  38.89 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  41.82 
 
 		 186 aa  40.8  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2665  type IV pilus modification protein PilV  42.37 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0914  general secretion pathway protein I  51.22 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.509918 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0214  hypothetical protein  28.68 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0020  type IV pilus modification protein PilV  27.5 
 
 		 159 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.908433  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  37.25 
 
 		 149 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>