11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0214 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0214  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  345  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0648  hypothetical protein  29.3 
 
 		 172 aa  51.6  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.814112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  34.92 
 
 		 205 aa  47.8  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  30.85 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  27.03 
 
 		 149 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3039  hypothetical protein  34.65 
 
 		 128 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.430738  normal  0.140833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0854  type IV pilus modification protein PilV  34.85 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3168  type IV pilus modification protein PilV  34.85 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1317  prepilin-type cleavage/methylation-like  36.14 
 
 		 616 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0115658 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1826  hypothetical protein  42.68 
 
 		 592 aa  43.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.252754  normal  0.485883 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2369  putative pilin, type IV  38.46 
 
 		 148 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.519243  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>