96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3228 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  100 
 
 		 170 aa  350  4e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  40.85 
 
 		 182 aa  103  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  44.44 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  38.31 
 
 		 177 aa  87  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0016  type IV pilus modification protein PilV  41.48 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0213  type IV pilus modification protein PilV  45.19 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.035208 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01321  type IV pilus modification protein PilV  37.98 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0020  type IV pilus modification protein PilV  37.04 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.908433  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0024  pre-pilin leader sequence  34.09 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  35.26 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  35.84 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0685  hypothetical protein  32.21 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0668  hypothetical protein  32.21 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5183  type IV pilus modification protein PilV  30.97 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0958149  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  34.75 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  34.51 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2953  type IV pilus modification protein PilV  33.33 
 
 		 188 aa  72  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.192573  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  52.63 
 
 		 171 aa  70.5  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  29.88 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  39.29 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0714  type IV pilus modification protein PilV  34.21 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2521  hypothetical protein  31.79 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1706  type IV pilus modification protein PilV  31.62 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1768  putative type IV pilus assembly protein PilV  31.62 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1125  type IV pilus modification protein PilV  30.92 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0671  type IV pilus modification protein PilV  33.55 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3231  type IV pilus modification protein PilV  30.92 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1160  type IV pilus modification protein PilV  32.68 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.574429 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3528  hypothetical protein  31.37 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1058  type IV pilus modification protein PilV  30.26 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2822  type IV pilus modification protein PilV  29.94 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0490  methylation  32.69 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  37.68 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11840  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilV-like protein  40.43 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2886  type IV pilus modification protein PilV  29.01 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.313421  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3132  type IV pilus modification protein PilV  30.61 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0727  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV-related transmembrane protein  33.08 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.698407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  50 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3035  type IV pilus modification protein PilV  33.33 
 
 		 186 aa  62  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0854  type IV pilus modification protein PilV  42.62 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5188  type IV pilus modification protein PilV  28.86 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3168  type IV pilus modification protein PilV  42.62 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2914  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  37.86 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3828  type IV pilus modification protein PilV  38.03 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1291  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV transmembrane protein  26.71 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5686  Type IV fimbrial biogenesis, pilV-related transmembrane protein  48.53 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3039  hypothetical protein  48.48 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.430738  normal  0.140833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2881  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  34.65 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1295  type IV pilus modification protein PilV  33.71 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.444338 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1063  type IV pilus modification protein PilV  40.3 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1103  type IV pilus modification protein PilV  36.76 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3106  type IV pilus modification protein PilV  50.85 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2719  methylation  36.76 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1087  type IV pilus modification protein PilV  36.76 
 
 		 186 aa  57  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2536  type IV pilus modification protein PilV  28.39 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2665  type IV pilus modification protein PilV  36.89 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03026  hypothetical protein  46.55 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  31.68 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0486  methylation  41.18 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  31.2 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5194  type IV pilus modification protein PilV  29.17 
 
 		 210 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.524323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1213  type IV pilus modification protein PilV  30.12 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0784  hypothetical protein  30.6 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0254  pilus assembly protein  29.66 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  35.09 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2023  hypothetical protein  41.38 
 
 		 180 aa  51.6  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1861  hypothetical protein  37.97 
 
 		 880 aa  51.6  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3405  fimbrial biogenesis protein  31.58 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0234  type IV fimbrial biogenesis protein PilV  35.59 
 
 		 216 aa  48.1  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2910  type IV pilus modification protein PilV  29.06 
 
 		 192 aa  47.8  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389723  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3174  hypothetical protein  41.38 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0189  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein PilV  24.84 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0928  type IV pilus assembly protein PilV  28.95 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0989  hypothetical protein  37.68 
 
 		 131 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.670007  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0970  type IV pilin, putative  25.31 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.42279  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1085  hypothetical protein  27.42 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0675  hypothetical protein  35.11 
 
 		 195 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2906  hypothetical protein  34.65 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.809421 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0214  hypothetical protein  30.85 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0488  hypothetical protein  38.33 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000470807  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2153  hypothetical protein  29.17 
 
 		 135 aa  44.7  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1198  type IV pilus modification protein PilV  27.4 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0708  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  30.68 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2678  type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  47 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3253  PilD-dependent protein  35 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0401  type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  35.71 
 
 		 200 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2838  type IV pilus modification protein PilV  44.12 
 
 		 199 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0708061  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0715  hypothetical protein  31.62 
 
 		 208 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.659875  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1522  putative pseudopilin J precursor  40.26 
 
 		 202 aa  42  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215294  normal  0.316231 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3314  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  37.93 
 
 		 132 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.424514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2405  hypothetical protein  29.23 
 
 		 305 aa  41.6  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1510  hypothetical protein  26.67 
 
 		 130 aa  41.6  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000935366  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2613  hypothetical protein  35.9 
 
 		 263 aa  41.6  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76594  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1034  hypothetical protein  46.81 
 
 		 141 aa  41.2  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3426  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.55 
 
 		 135 aa  40.8  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3164  prepilin-type cleavage/methylation-like  26.67 
 
 		 554 aa  40.8  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00552698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>