28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3253 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3253  PilD-dependent protein  100 
 
 		 138 aa  286  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0708  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.13 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3314  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.13 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.424514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3426  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  29.13 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0486  methylation  30.97 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0851  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  30.4 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.967837 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0863  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  30.4 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0828  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  30.4 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3168  type IV pilus modification protein PilV  35.59 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0854  type IV pilus modification protein PilV  35.59 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0852  hypothetical protein  27.69 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  36.84 
 
 		 177 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0020  type IV pilus modification protein PilV  35.94 
 
 		 159 aa  43.5  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.908433  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  27.08 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1087  type IV pilus modification protein PilV  31.58 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0024  pre-pilin leader sequence  35.94 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0388  putative type IV pilin  32.88 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  35 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2719  methylation  35.37 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  33.33 
 
 		 182 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  34.33 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  34.33 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1295  type IV pilus modification protein PilV  32.43 
 
 		 188 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.444338 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0320  general secretion pathway protein I  33.9 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  31.33 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3528  hypothetical protein  28.05 
 
 		 187 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0668  hypothetical protein  35.29 
 
 		 179 aa  40  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0685  hypothetical protein  35.29 
 
 		 179 aa  40  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>