53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2719 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2719  methylation  100 
 
 		 184 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1295  type IV pilus modification protein PilV  59.26 
 
 		 188 aa  219  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.444338 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3528  hypothetical protein  57.22 
 
 		 187 aa  204  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1160  type IV pilus modification protein PilV  56.67 
 
 		 195 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.574429 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1058  type IV pilus modification protein PilV  56.67 
 
 		 195 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3035  type IV pilus modification protein PilV  55.98 
 
 		 186 aa  202  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3231  type IV pilus modification protein PilV  56.11 
 
 		 195 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1103  type IV pilus modification protein PilV  55.43 
 
 		 173 aa  201  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1125  type IV pilus modification protein PilV  56.11 
 
 		 187 aa  200  7e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3132  type IV pilus modification protein PilV  56.98 
 
 		 186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1063  type IV pilus modification protein PilV  56.18 
 
 		 183 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1087  type IV pilus modification protein PilV  51.6 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2886  type IV pilus modification protein PilV  49.47 
 
 		 182 aa  178  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.313421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2953  type IV pilus modification protein PilV  51.65 
 
 		 188 aa  174  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.192573  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1198  type IV pilus modification protein PilV  51.35 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0928  type IV pilus assembly protein PilV  50.82 
 
 		 172 aa  168  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1213  type IV pilus modification protein PilV  36.96 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11840  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilV-like protein  31.69 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5686  Type IV fimbrial biogenesis, pilV-related transmembrane protein  33.12 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2914  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  30.32 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  33.04 
 
 		 177 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2881  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  29.88 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  34.55 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2678  type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  35.06 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  48.21 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  36.76 
 
 		 170 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0090  type IV fimbrial biogenesis protein PilV, putative  32.14 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.662578  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  32.06 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0685  hypothetical protein  28.97 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0668  hypothetical protein  28.97 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  30.77 
 
 		 156 aa  52.4  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2838  type IV pilus modification protein PilV  24.82 
 
 		 199 aa  51.2  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0708061  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0020  type IV pilus modification protein PilV  37.1 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.908433  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0024  pre-pilin leader sequence  37.1 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  30.25 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  35.09 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0401  type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  34.84 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  25.82 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  39.29 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2822  type IV pilus modification protein PilV  37.93 
 
 		 223 aa  45.1  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0213  type IV pilus modification protein PilV  34.91 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.035208 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  23.08 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  37.1 
 
 		 149 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3234  prepilin peptidase dependent protein  35.19 
 
 		 121 aa  43.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.568305 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  33.72 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0486  methylation  42.31 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0714  type IV pilus modification protein PilV  31.25 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1040  prepilin peptidase dependent protein-like protein  35.19 
 
 		 136 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.635785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0988  prepilin peptidase dependent protein-like protein  35.19 
 
 		 136 aa  43.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3253  PilD-dependent protein  35.37 
 
 		 138 aa  42.4  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5188  type IV pilus modification protein PilV  23.03 
 
 		 206 aa  41.2  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3106  type IV pilus modification protein PilV  27.78 
 
 		 185 aa  41.2  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0671  type IV pilus modification protein PilV  29.46 
 
 		 167 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.663596 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>