61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0090 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0090  type IV fimbrial biogenesis protein PilV, putative  100 
 
 		 196 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.662578  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2953  type IV pilus modification protein PilV  36.96 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.192573  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3132  type IV pilus modification protein PilV  34.78 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3035  type IV pilus modification protein PilV  35.64 
 
 		 186 aa  91.3  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1103  type IV pilus modification protein PilV  32.97 
 
 		 173 aa  89.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1125  type IV pilus modification protein PilV  31.09 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3528  hypothetical protein  32.12 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3231  type IV pilus modification protein PilV  31.09 
 
 		 195 aa  88.2  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1058  type IV pilus modification protein PilV  31.09 
 
 		 195 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1063  type IV pilus modification protein PilV  31.96 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2886  type IV pilus modification protein PilV  30.32 
 
 		 182 aa  87  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.313421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1160  type IV pilus modification protein PilV  29.02 
 
 		 195 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.574429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1087  type IV pilus modification protein PilV  29.74 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1295  type IV pilus modification protein PilV  32.29 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.444338 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2719  methylation  32.14 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1213  type IV pilus modification protein PilV  30.05 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1198  type IV pilus modification protein PilV  34.04 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0928  type IV pilus assembly protein PilV  30 
 
 		 172 aa  72  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2881  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  32.32 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5686  Type IV fimbrial biogenesis, pilV-related transmembrane protein  33.16 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  36.69 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  33.81 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11840  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilV-like protein  31.58 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0854  type IV pilus modification protein PilV  45.16 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3168  type IV pilus modification protein PilV  45.16 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0024  pre-pilin leader sequence  40.37 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2914  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  28.06 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0020  type IV pilus modification protein PilV  39.45 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.908433  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  44.26 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  44.78 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  39.47 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0401  type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  32.16 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  30.18 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0685  hypothetical protein  30.86 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0668  hypothetical protein  30.86 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  24.2 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1861  hypothetical protein  44.64 
 
 		 880 aa  51.6  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0486  methylation  26.57 
 
 		 139 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  35.21 
 
 		 149 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  30.13 
 
 		 165 aa  48.5  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  37.93 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2678  type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  30.89 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3828  type IV pilus modification protein PilV  34.92 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03026  hypothetical protein  36 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  34.94 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0488  hypothetical protein  41.51 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000470807  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  28.91 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0016  type IV pilus modification protein PilV  33.33 
 
 		 159 aa  45.1  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  33.33 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  36.49 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2838  type IV pilus modification protein PilV  31.29 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0708061  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5183  type IV pilus modification protein PilV  40 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0958149  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0254  pilus assembly protein  41.18 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  23.28 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0234  type IV fimbrial biogenesis protein PilV  37.93 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2536  type IV pilus modification protein PilV  23.12 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1768  putative type IV pilus assembly protein PilV  30.88 
 
 		 160 aa  41.6  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1706  type IV pilus modification protein PilV  30.88 
 
 		 160 aa  41.6  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3174  hypothetical protein  38 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3253  PilD-dependent protein  35.29 
 
 		 138 aa  41.6  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3039  hypothetical protein  35.59 
 
 		 128 aa  41.6  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.430738  normal  0.140833 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>