50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2914 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2914  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  100 
 
 		 198 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2678  type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  75.14 
 
 		 196 aa  256  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5686  Type IV fimbrial biogenesis, pilV-related transmembrane protein  62.37 
 
 		 202 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0401  type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  65.76 
 
 		 200 aa  223  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2881  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  41.67 
 
 		 189 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11840  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilV-like protein  44.39 
 
 		 177 aa  121  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2838  type IV pilus modification protein PilV  43.28 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0708061  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3132  type IV pilus modification protein PilV  29.24 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2719  methylation  30.32 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1103  type IV pilus modification protein PilV  32.68 
 
 		 173 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3528  hypothetical protein  28.65 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2953  type IV pilus modification protein PilV  27.33 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.192573  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  33.77 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3035  type IV pilus modification protein PilV  26.92 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1213  type IV pilus modification protein PilV  31.33 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1087  type IV pilus modification protein PilV  31.41 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1160  type IV pilus modification protein PilV  29.07 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.574429 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1058  type IV pilus modification protein PilV  28.82 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1063  type IV pilus modification protein PilV  27.69 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3231  type IV pilus modification protein PilV  28.82 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1125  type IV pilus modification protein PilV  28.82 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0668  hypothetical protein  39.33 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0685  hypothetical protein  39.29 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  37.86 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2886  type IV pilus modification protein PilV  24.62 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.313421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1295  type IV pilus modification protein PilV  27.67 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.444338 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  34.35 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1198  type IV pilus modification protein PilV  31.07 
 
 		 173 aa  51.6  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  31.68 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  27.19 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2536  type IV pilus modification protein PilV  30.23 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  33.33 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0213  type IV pilus modification protein PilV  32.69 
 
 		 156 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.035208 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5183  type IV pilus modification protein PilV  43.48 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0958149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  28.33 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0486  methylation  29.55 
 
 		 139 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2910  type IV pilus modification protein PilV  32.46 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389723  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  32.69 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0928  type IV pilus assembly protein PilV  29.83 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0854  type IV pilus modification protein PilV  37.1 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3168  type IV pilus modification protein PilV  37.1 
 
 		 138 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  29.27 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3828  type IV pilus modification protein PilV  23.14 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2822  type IV pilus modification protein PilV  32.43 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0024  pre-pilin leader sequence  37.5 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  37.8 
 
 		 149 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0020  type IV pilus modification protein PilV  37.04 
 
 		 159 aa  43.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.908433  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  40 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  26.92 
 
 		 156 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  42.11 
 
 		 171 aa  41.6  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>