48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0401 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0401  type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  100 
 
 		 200 aa  394  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2914  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  65.76 
 
 		 198 aa  245  3e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5686  Type IV fimbrial biogenesis, pilV-related transmembrane protein  62 
 
 		 202 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2678  type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  63.04 
 
 		 196 aa  210  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2881  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  44.83 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11840  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilV-like protein  43.62 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2838  type IV pilus modification protein PilV  40.55 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0708061  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1063  type IV pilus modification protein PilV  33.33 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3132  type IV pilus modification protein PilV  31.17 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2953  type IV pilus modification protein PilV  33.54 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.192573  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2719  methylation  34.84 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1058  type IV pilus modification protein PilV  30.93 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1103  type IV pilus modification protein PilV  32.14 
 
 		 173 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3528  hypothetical protein  30.81 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3231  type IV pilus modification protein PilV  30.93 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1125  type IV pilus modification protein PilV  30.93 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3035  type IV pilus modification protein PilV  29.27 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1160  type IV pilus modification protein PilV  31.21 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.574429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1087  type IV pilus modification protein PilV  30.27 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  36.52 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2886  type IV pilus modification protein PilV  27.45 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.313421  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  35.71 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1213  type IV pilus modification protein PilV  31.52 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1295  type IV pilus modification protein PilV  33.33 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.444338 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  28 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0668  hypothetical protein  30.23 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0090  type IV fimbrial biogenesis protein PilV, putative  32.16 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.662578  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0685  hypothetical protein  30.23 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0213  type IV pilus modification protein PilV  35.65 
 
 		 156 aa  51.6  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.035208 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0928  type IV pilus assembly protein PilV  32.43 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  32.11 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2822  type IV pilus modification protein PilV  41.67 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2536  type IV pilus modification protein PilV  31.48 
 
 		 237 aa  48.5  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  42.19 
 
 		 155 aa  48.1  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  30.7 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5183  type IV pilus modification protein PilV  45.16 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0958149  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2910  type IV pilus modification protein PilV  30.3 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389723  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5188  type IV pilus modification protein PilV  28.15 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  32.23 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  30.13 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  35.48 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1198  type IV pilus modification protein PilV  30 
 
 		 173 aa  45.4  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3168  type IV pilus modification protein PilV  38.71 
 
 		 138 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0854  type IV pilus modification protein PilV  38.71 
 
 		 138 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3828  type IV pilus modification protein PilV  33.9 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2023  hypothetical protein  40 
 
 		 180 aa  41.6  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5194  type IV pilus modification protein PilV  26.86 
 
 		 210 aa  41.2  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.524323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  33.33 
 
 		 186 aa  41.2  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>