72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3168 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0854  type IV pilus modification protein PilV  100 
 
 		 138 aa  285  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3168  type IV pilus modification protein PilV  100 
 
 		 138 aa  285  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0486  methylation  30.3 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  31.08 
 
 		 177 aa  62  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  31.03 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  31.34 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0708  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  30 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2881  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  29.32 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3426  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  30 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3314  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  30 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.424514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  42.62 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  40 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0254  pilus assembly protein  32.58 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1213  type IV pilus modification protein PilV  36.71 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  43.64 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  40.98 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03026  hypothetical protein  50 
 
 		 220 aa  53.9  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  40.98 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0020  type IV pilus modification protein PilV  29.25 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.908433  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  44.64 
 
 		 186 aa  52  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  47.27 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3253  PilD-dependent protein  35.59 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2886  type IV pilus modification protein PilV  38.33 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.313421  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  26.57 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3039  hypothetical protein  30.97 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.430738  normal  0.140833 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0851  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  32.76 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.967837 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0024  pre-pilin leader sequence  39.34 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0863  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  32.76 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0828  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  32.76 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3106  type IV pilus modification protein PilV  38.98 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1103  type IV pilus modification protein PilV  28.42 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5188  type IV pilus modification protein PilV  37.7 
 
 		 206 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0016  type IV pilus modification protein PilV  36.84 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  34.48 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2953  type IV pilus modification protein PilV  34.43 
 
 		 188 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.192573  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3132  type IV pilus modification protein PilV  34.43 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11840  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilV-like protein  42.59 
 
 		 177 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2665  type IV pilus modification protein PilV  25.78 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2914  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  37.1 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  31.67 
 
 		 225 aa  45.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0852  hypothetical protein  30.43 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3231  type IV pilus modification protein PilV  35 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1291  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV transmembrane protein  24.68 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1160  type IV pilus modification protein PilV  35 
 
 		 195 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.574429 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1125  type IV pilus modification protein PilV  35 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1087  type IV pilus modification protein PilV  33.33 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3528  hypothetical protein  35.09 
 
 		 187 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1295  type IV pilus modification protein PilV  35.71 
 
 		 188 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.444338 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0668  hypothetical protein  34.48 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1063  type IV pilus modification protein PilV  35.09 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0685  hypothetical protein  34.48 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  30.51 
 
 		 205 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0090  type IV fimbrial biogenesis protein PilV, putative  45.16 
 
 		 196 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.662578  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2536  type IV pilus modification protein PilV  35.09 
 
 		 237 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1058  type IV pilus modification protein PilV  33.33 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0214  hypothetical protein  34.85 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  35.09 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3405  fimbrial biogenesis protein  39.53 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  33.93 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3035  type IV pilus modification protein PilV  32.2 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1861  hypothetical protein  27.63 
 
 		 880 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0213  type IV pilus modification protein PilV  28.15 
 
 		 156 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.035208 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0784  hypothetical protein  38.46 
 
 		 194 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1706  type IV pilus modification protein PilV  25.36 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1768  putative type IV pilus assembly protein PilV  25.36 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2822  type IV pilus modification protein PilV  37.29 
 
 		 223 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5686  Type IV fimbrial biogenesis, pilV-related transmembrane protein  36.21 
 
 		 202 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0514  MSHA pilin protein MshD  22.31 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0167076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2910  type IV pilus modification protein PilV  32.79 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389723  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3476  methylation site containing protein  22.83 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000829017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3428  hypothetical protein  36.84 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2023  hypothetical protein  37.29 
 
 		 180 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>