35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2023 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2023  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  369  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0263  putative type IV fimbrial biogenesis protein PilV  31.52 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.427533 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0234  type IV fimbrial biogenesis protein PilV  27.44 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  26.47 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  41.38 
 
 		 170 aa  51.6  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  32.14 
 
 		 170 aa  51.2  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  41.67 
 
 		 149 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2822  type IV pilus modification protein PilV  40.62 
 
 		 223 aa  47.8  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  31.03 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  32.31 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5183  type IV pilus modification protein PilV  33.75 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0958149  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2881  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  38.46 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3828  type IV pilus modification protein PilV  36.07 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  32.88 
 
 		 219 aa  45.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03026  hypothetical protein  37.93 
 
 		 220 aa  45.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0016  type IV pilus modification protein PilV  38.57 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  38.33 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  37.5 
 
 		 157 aa  45.1  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  29.17 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  35.37 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  36.21 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5686  Type IV fimbrial biogenesis, pilV-related transmembrane protein  40.32 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0784  hypothetical protein  43.86 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2536  type IV pilus modification protein PilV  35.09 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  28.18 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5188  type IV pilus modification protein PilV  25.47 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0671  type IV pilus modification protein PilV  32.65 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  28.44 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5194  type IV pilus modification protein PilV  31.73 
 
 		 210 aa  42  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.524323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0486  methylation  35.48 
 
 		 139 aa  41.6  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0714  type IV pilus modification protein PilV  31.63 
 
 		 167 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2838  type IV pilus modification protein PilV  32.37 
 
 		 199 aa  42  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0708061  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  36.07 
 
 		 225 aa  41.6  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1213  type IV pilus modification protein PilV  30.39 
 
 		 193 aa  41.2  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1510  hypothetical protein  32.76 
 
 		 130 aa  40.8  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000935366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>