45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2910 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2910  type IV pilus modification protein PilV  100 
 
 		 192 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389723  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5194  type IV pilus modification protein PilV  32.8 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.524323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5188  type IV pilus modification protein PilV  32.78 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2536  type IV pilus modification protein PilV  37.01 
 
 		 237 aa  95.9  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  41.94 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3828  type IV pilus modification protein PilV  32.17 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  33.33 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3106  type IV pilus modification protein PilV  37.82 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  29.52 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1291  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV transmembrane protein  33.6 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0213  type IV pilus modification protein PilV  30.56 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.035208 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  28.16 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0668  hypothetical protein  29.37 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2881  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  32.35 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0685  hypothetical protein  29.37 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  28.39 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0016  type IV pilus modification protein PilV  32.14 
 
 		 159 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  25.32 
 
 		 177 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1103  type IV pilus modification protein PilV  34.26 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2665  type IV pilus modification protein PilV  27.5 
 
 		 160 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5686  Type IV fimbrial biogenesis, pilV-related transmembrane protein  34.07 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2886  type IV pilus modification protein PilV  27.21 
 
 		 182 aa  48.1  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.313421  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  29.06 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3528  hypothetical protein  27.67 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  28.83 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0784  hypothetical protein  27.48 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  29.1 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2914  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  32.46 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  29.91 
 
 		 155 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2953  type IV pilus modification protein PilV  28.3 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.192573  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3039  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  45.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.430738  normal  0.140833 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1063  type IV pilus modification protein PilV  33.64 
 
 		 183 aa  44.7  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0189  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein PilV  25.41 
 
 		 180 aa  44.7  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2678  type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  32.46 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3035  type IV pilus modification protein PilV  30 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0486  methylation  34.85 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3132  type IV pilus modification protein PilV  27.34 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01321  type IV pilus modification protein PilV  29.29 
 
 		 138 aa  43.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1058  type IV pilus modification protein PilV  26.06 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  25.32 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11840  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilV-like protein  36.21 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  26.53 
 
 		 171 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1160  type IV pilus modification protein PilV  25.97 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.574429 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1861  hypothetical protein  35.38 
 
 		 880 aa  41.6  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3231  type IV pilus modification protein PilV  26.06 
 
 		 195 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>