20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01321 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01321  type IV pilus modification protein PilV  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  55.17 
 
 		 165 aa  153  6e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1706  type IV pilus modification protein PilV  46.76 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1768  putative type IV pilus assembly protein PilV  46.76 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  37.98 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  38.28 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0213  type IV pilus modification protein PilV  34.35 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.035208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  30.95 
 
 		 171 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  29.2 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  30.15 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  29.77 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  31.3 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3828  type IV pilus modification protein PilV  27.14 
 
 		 215 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2910  type IV pilus modification protein PilV  29.29 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389723  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5194  type IV pilus modification protein PilV  29.2 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.524323  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3528  hypothetical protein  27.19 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  36.07 
 
 		 225 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  33.01 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0024  pre-pilin leader sequence  23.31 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  40.82 
 
 		 219 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>