42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1768 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1706  type IV pilus modification protein PilV  100 
 
 		 160 aa  334  2.9999999999999997e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1768  putative type IV pilus assembly protein PilV  100 
 
 		 160 aa  334  2.9999999999999997e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01321  type IV pilus modification protein PilV  46.76 
 
 		 138 aa  120  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.539325  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  46.36 
 
 		 165 aa  119  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  35.56 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  31.62 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0213  type IV pilus modification protein PilV  34.01 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.035208 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  29.92 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  32.14 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0024  pre-pilin leader sequence  47.37 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0016  type IV pilus modification protein PilV  49.12 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0020  type IV pilus modification protein PilV  47.37 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.908433  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  26.83 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  27.89 
 
 		 171 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0685  hypothetical protein  24.85 
 
 		 179 aa  50.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  28.1 
 
 		 177 aa  50.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0668  hypothetical protein  26.35 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2665  type IV pilus modification protein PilV  34.33 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  37.14 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  28.39 
 
 		 219 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  44.44 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  28.28 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3828  type IV pilus modification protein PilV  29.25 
 
 		 215 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3035  type IV pilus modification protein PilV  34.48 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3039  hypothetical protein  27.54 
 
 		 128 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.430738  normal  0.140833 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  40.74 
 
 		 185 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03026  hypothetical protein  34.44 
 
 		 220 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1125  type IV pilus modification protein PilV  34.48 
 
 		 187 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3106  type IV pilus modification protein PilV  31.34 
 
 		 185 aa  43.9  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1087  type IV pilus modification protein PilV  26.57 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  35.85 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3023  hypothetical protein  30.59 
 
 		 437 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2886  type IV pilus modification protein PilV  33.33 
 
 		 182 aa  42.4  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.313421  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  33.96 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3231  type IV pilus modification protein PilV  33.33 
 
 		 195 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3132  type IV pilus modification protein PilV  32.94 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1103  type IV pilus modification protein PilV  28.85 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0234  type IV fimbrial biogenesis protein PilV  38.89 
 
 		 216 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0714  type IV pilus modification protein PilV  28.32 
 
 		 167 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0854  type IV pilus modification protein PilV  25.36 
 
 		 138 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3168  type IV pilus modification protein PilV  25.36 
 
 		 138 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0671  type IV pilus modification protein PilV  28.32 
 
 		 167 aa  40.8  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.663596 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>