52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0784 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0784  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  36.04 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  30.77 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5183  type IV pilus modification protein PilV  28.06 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0958149  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  31.33 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0668  hypothetical protein  28.99 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0685  hypothetical protein  28.4 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1291  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV transmembrane protein  36.59 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3828  type IV pilus modification protein PilV  28.23 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  30.17 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2953  type IV pilus modification protein PilV  28.97 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.192573  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  26.52 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  30.65 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2536  type IV pilus modification protein PilV  29.27 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3035  type IV pilus modification protein PilV  29.73 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  30.6 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2886  type IV pilus modification protein PilV  31.78 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.313421  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  47.27 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5188  type IV pilus modification protein PilV  28.69 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  30.41 
 
 		 157 aa  51.6  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  40.32 
 
 		 171 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1295  type IV pilus modification protein PilV  29.55 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.444338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  29.17 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  33.33 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  25.62 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3132  type IV pilus modification protein PilV  29.17 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3528  hypothetical protein  32.11 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5194  type IV pilus modification protein PilV  28.81 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.524323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3174  hypothetical protein  28.79 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  31.78 
 
 		 165 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2910  type IV pilus modification protein PilV  27.48 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389723  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3106  type IV pilus modification protein PilV  28.42 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1063  type IV pilus modification protein PilV  30.48 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1125  type IV pilus modification protein PilV  29.73 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1103  type IV pilus modification protein PilV  28.04 
 
 		 173 aa  45.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2881  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  39.68 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0189  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein PilV  30.16 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3231  type IV pilus modification protein PilV  29.46 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0213  type IV pilus modification protein PilV  32.2 
 
 		 156 aa  45.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.035208 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1087  type IV pilus modification protein PilV  30.09 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0388  putative type IV pilin  30.15 
 
 		 125 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1160  type IV pilus modification protein PilV  28.57 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.574429 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0671  type IV pilus modification protein PilV  33.33 
 
 		 167 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2023  hypothetical protein  43.86 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1058  type IV pilus modification protein PilV  28.57 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  32.91 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0024  pre-pilin leader sequence  39.06 
 
 		 159 aa  42  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2822  type IV pilus modification protein PilV  31.88 
 
 		 223 aa  42.4  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0714  type IV pilus modification protein PilV  32.72 
 
 		 167 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0020  type IV pilus modification protein PilV  39.06 
 
 		 159 aa  41.6  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.908433  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3168  type IV pilus modification protein PilV  38.46 
 
 		 138 aa  41.2  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0854  type IV pilus modification protein PilV  38.46 
 
 		 138 aa  41.2  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>