24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3174 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3174  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  390  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03026  hypothetical protein  49.22 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  24.57 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  47.06 
 
 		 155 aa  51.2  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2536  type IV pilus modification protein PilV  24.43 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0714  type IV pilus modification protein PilV  26.38 
 
 		 167 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  31.06 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0671  type IV pilus modification protein PilV  27.61 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0020  type IV pilus modification protein PilV  38.98 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.908433  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0024  pre-pilin leader sequence  38.98 
 
 		 159 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  41.38 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0784  hypothetical protein  28.79 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0668  hypothetical protein  26.12 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0685  hypothetical protein  26.12 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  22.92 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3828  type IV pilus modification protein PilV  26.05 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  25.58 
 
 		 157 aa  45.1  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2881  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  43.14 
 
 		 189 aa  45.1  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  33.02 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11840  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilV-like protein  43.14 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1291  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV transmembrane protein  28.26 
 
 		 179 aa  42  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0016  type IV pilus modification protein PilV  35.29 
 
 		 159 aa  42  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5188  type IV pilus modification protein PilV  35.29 
 
 		 206 aa  42  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  25.53 
 
 		 219 aa  41.6  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>