57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5191 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  100 
 
 		 185 aa  380  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  45.9 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2882  type IV pilus modification protein PilV  36.81 
 
 		 181 aa  85.1  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2822  type IV pilus modification protein PilV  24.71 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2536  type IV pilus modification protein PilV  28.22 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  31.3 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5188  type IV pilus modification protein PilV  31.13 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1291  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV transmembrane protein  25.52 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3828  type IV pilus modification protein PilV  30.5 
 
 		 215 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  30.89 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  31.09 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  29.23 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0234  type IV fimbrial biogenesis protein PilV  37.23 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  27.56 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  23.73 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1063  type IV pilus modification protein PilV  25 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3106  type IV pilus modification protein PilV  26.99 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2665  type IV pilus modification protein PilV  28.03 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  35.09 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  41.82 
 
 		 155 aa  52.4  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3405  fimbrial biogenesis protein  45.45 
 
 		 151 aa  52.4  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  37.5 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0784  hypothetical protein  29.17 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  37.5 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5194  type IV pilus modification protein PilV  30.84 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.524323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3039  hypothetical protein  35.38 
 
 		 128 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.430738  normal  0.140833 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0016  type IV pilus modification protein PilV  26.87 
 
 		 159 aa  49.3  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  36.21 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1213  type IV pilus modification protein PilV  37.31 
 
 		 193 aa  48.5  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  36.21 
 
 		 171 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2886  type IV pilus modification protein PilV  23.64 
 
 		 182 aa  48.1  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.313421  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  37.93 
 
 		 182 aa  48.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3168  type IV pilus modification protein PilV  34.48 
 
 		 138 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0854  type IV pilus modification protein PilV  34.48 
 
 		 138 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3231  type IV pilus modification protein PilV  25 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03026  hypothetical protein  29.33 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1125  type IV pilus modification protein PilV  24.56 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1058  type IV pilus modification protein PilV  25.3 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1160  type IV pilus modification protein PilV  23.6 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.574429 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0486  methylation  40.68 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1033  hypothetical protein  32.35 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.404821 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0024  pre-pilin leader sequence  35.71 
 
 		 159 aa  45.1  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1103  type IV pilus modification protein PilV  24.2 
 
 		 173 aa  45.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0020  type IV pilus modification protein PilV  35.71 
 
 		 159 aa  45.1  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.908433  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1768  putative type IV pilus assembly protein PilV  40.74 
 
 		 160 aa  44.7  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1706  type IV pilus modification protein PilV  40.74 
 
 		 160 aa  44.7  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0756  hypothetical protein  34.33 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0189  type-4 fimbrial biogenesis transmembrane protein PilV  28.57 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3528  hypothetical protein  22.88 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1538  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  38.1 
 
 		 136 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0675  hypothetical protein  27.78 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0727  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV-related transmembrane protein  25.55 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.698407 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2023  hypothetical protein  28.18 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1295  type IV pilus modification protein PilV  23.64 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.444338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1087  type IV pilus modification protein PilV  22.78 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5183  type IV pilus modification protein PilV  25.44 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0958149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>