50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3405 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3405  fimbrial biogenesis protein  100 
 
 		 151 aa  301  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430921 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2665  type IV pilus modification protein PilV  30.94 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  45.45 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  39.08 
 
 		 205 aa  60.1  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  31.58 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3039  hypothetical protein  31.67 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.430738  normal  0.140833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1213  type IV pilus modification protein PilV  46.77 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  41.67 
 
 		 225 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3106  type IV pilus modification protein PilV  45.61 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3132  type IV pilus modification protein PilV  35.94 
 
 		 186 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  30.28 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  48.98 
 
 		 186 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1160  type IV pilus modification protein PilV  25.83 
 
 		 195 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.574429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0854  type IV pilus modification protein PilV  31.06 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2953  type IV pilus modification protein PilV  35.94 
 
 		 188 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.192573  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3168  type IV pilus modification protein PilV  31.06 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3231  type IV pilus modification protein PilV  25.83 
 
 		 195 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  40.58 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  36.36 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  40 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  28.32 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1058  type IV pilus modification protein PilV  25.17 
 
 		 195 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2881  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  37.74 
 
 		 189 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  34.11 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2822  type IV pilus modification protein PilV  46.3 
 
 		 223 aa  48.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1125  type IV pilus modification protein PilV  25.17 
 
 		 187 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3528  hypothetical protein  35.59 
 
 		 187 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  40.35 
 
 		 171 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3035  type IV pilus modification protein PilV  32.79 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2521  hypothetical protein  28.06 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  41.07 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2914  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  35.94 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  32.86 
 
 		 219 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2838  type IV pilus modification protein PilV  31.69 
 
 		 199 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0708061  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  34.78 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2910  type IV pilus modification protein PilV  30.94 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389723  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1087  type IV pilus modification protein PilV  30.65 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  24.56 
 
 		 177 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11840  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilV-like protein  40.68 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0486  methylation  39.34 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2886  type IV pilus modification protein PilV  29.82 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.313421  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0016  type IV pilus modification protein PilV  29.6 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1063  type IV pilus modification protein PilV  29.03 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3828  type IV pilus modification protein PilV  30.91 
 
 		 215 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1291  putative type-4 fimbrial biogenesis PILV transmembrane protein  35.09 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1103  type IV pilus modification protein PilV  27.59 
 
 		 173 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0675  hypothetical protein  36.62 
 
 		 195 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2536  type IV pilus modification protein PilV  36.84 
 
 		 237 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1295  type IV pilus modification protein PilV  25.81 
 
 		 188 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.444338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0784  hypothetical protein  31.03 
 
 		 194 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>