18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3234 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3234  prepilin peptidase dependent protein  100 
 
 		 121 aa  249  6e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.568305 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1040  prepilin peptidase dependent protein-like protein  99.17 
 
 		 136 aa  249  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.635785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0988  prepilin peptidase dependent protein-like protein  99.17 
 
 		 136 aa  249  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3817  putative prepilin peptidase dependent protein c precursor  48.57 
 
 		 113 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630035  normal  0.0912709 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3392  putative prepilin peptidase dependent protein c precursor  40.18 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.176023  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3191  hypothetical protein  37.61 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0911  putative prepilin peptidase dependent protein c precursor  36.44 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3010  hypothetical protein  43.24 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2719  methylation  35.19 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1058  type IV pilus modification protein PilV  37.25 
 
 		 195 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3132  type IV pilus modification protein PilV  37.04 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1125  type IV pilus modification protein PilV  33.33 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1861  hypothetical protein  46.15 
 
 		 880 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1160  type IV pilus modification protein PilV  37.25 
 
 		 195 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.574429 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2953  type IV pilus modification protein PilV  44.44 
 
 		 188 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.192573  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3231  type IV pilus modification protein PilV  37.25 
 
 		 195 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3266  hypothetical protein  25.45 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334582  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3528  hypothetical protein  37.25 
 
 		 187 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>