18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3392 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3392  putative prepilin peptidase dependent protein c precursor  100 
 
 		 130 aa  267  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.176023  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0911  putative prepilin peptidase dependent protein c precursor  84.62 
 
 		 129 aa  189  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3191  hypothetical protein  51.61 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3817  putative prepilin peptidase dependent protein c precursor  51.33 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630035  normal  0.0912709 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3010  hypothetical protein  53.6 
 
 		 131 aa  88.6  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0988  prepilin peptidase dependent protein-like protein  40.18 
 
 		 136 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1040  prepilin peptidase dependent protein-like protein  40.18 
 
 		 136 aa  87  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.635785  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3234  prepilin peptidase dependent protein  39.47 
 
 		 121 aa  87  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.568305 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3223  hypothetical protein  30.36 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  0.0263221 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3209  hypothetical protein  30.36 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.13365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3143  hypothetical protein  30.36 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3323  hypothetical protein  30.36 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0403449 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3266  hypothetical protein  29.03 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334582  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02671  hypothetical protein  24.35 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.561145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0892  hypothetical protein  24.35 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02632  hypothetical protein  24.35 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.510371  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2969  hypothetical protein  24.35 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0868  prepilin peptidase-dependent protein C  24.35 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>