21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3191 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3191  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  262  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0911  putative prepilin peptidase dependent protein c precursor  55.26 
 
 
129 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3392  putative prepilin peptidase dependent protein c precursor  51.61 
 
 
130 aa  102  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.176023  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3817  putative prepilin peptidase dependent protein c precursor  56.6 
 
 
113 aa  98.6  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630035  normal  0.0912709 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3010  hypothetical protein  59.63 
 
 
131 aa  96.7  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0988  prepilin peptidase dependent protein-like protein  37.61 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3234  prepilin peptidase dependent protein  37.61 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.568305 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1040  prepilin peptidase dependent protein-like protein  37.61 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.635785  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2970  hypothetical protein  30.39 
 
 
115 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.254629  normal  0.0125225 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3039  hypothetical protein  29.41 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02632  hypothetical protein  29.41 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.510371  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4088  hypothetical protein  29.41 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.198399  normal  0.676509 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02671  hypothetical protein  29.41 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.561145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0892  hypothetical protein  29.41 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2969  hypothetical protein  29.41 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0868  prepilin peptidase-dependent protein C  29.41 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3266  hypothetical protein  27.36 
 
 
107 aa  43.5  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.334582  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3143  hypothetical protein  32.35 
 
 
106 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3323  hypothetical protein  32.35 
 
 
106 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0403449 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3209  hypothetical protein  31.37 
 
 
106 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.13365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3223  hypothetical protein  31.37 
 
 
106 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  0.0263221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>