15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0852 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0852  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  282  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3426  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  88.81 
 
 		 135 aa  248  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0708  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  92.06 
 
 		 132 aa  244  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3314  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  92.06 
 
 		 132 aa  244  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.424514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0828  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  80.31 
 
 		 136 aa  194  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0863  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  80.31 
 
 		 136 aa  194  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0851  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  79.53 
 
 		 136 aa  192  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.967837 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3253  PilD-dependent protein  27.69 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0854  type IV pilus modification protein PilV  30.43 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3168  type IV pilus modification protein PilV  30.43 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0486  methylation  32 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0254  pilus assembly protein  33.33 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  29.84 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0525  hypothetical protein  34.62 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.405508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  36.51 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>