50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0490 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0490  methylation  100 
 
 		 152 aa  306  6.999999999999999e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  32.69 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0024  pre-pilin leader sequence  33.86 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0020  type IV pilus modification protein PilV  35.16 
 
 		 159 aa  70.1  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.908433  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2158  hypothetical protein  34.59 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000473129  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2561  ribosome recycling factor  30.2 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19815  normal  0.374667 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  29.71 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2822  type IV pilus modification protein PilV  36.15 
 
 		 223 aa  57  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0016  type IV pilus modification protein PilV  41.54 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3554  type IV pilus modification protein PilV  34.92 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.431306  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2881  putative type 4 fimbrial biogenesis related transmembrane protein  32.23 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.779883  normal  0.387783 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2660  methylation  45.61 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  30.36 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0858  type IV pilus modification protein PilV  40.85 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03026  hypothetical protein  46.97 
 
 		 220 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0213  type IV pilus modification protein PilV  35.86 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.035208 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0854  type IV pilus modification protein PilV  35.4 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0668  hypothetical protein  28.77 
 
 		 179 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3168  type IV pilus modification protein PilV  35.4 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0685  hypothetical protein  28.77 
 
 		 179 aa  50.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0486  methylation  53.57 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3106  type IV pilus modification protein PilV  37.78 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2665  type IV pilus modification protein PilV  30.33 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.636874  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4846  hypothetical protein  32.8 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2910  type IV pilus modification protein PilV  36.62 
 
 		 192 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.389723  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0716  type IV pilus assembly protein PilV  35.56 
 
 		 171 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  43.1 
 
 		 171 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  38.33 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3828  type IV pilus modification protein PilV  36.67 
 
 		 215 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200288 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2886  type IV pilus modification protein PilV  30.3 
 
 		 182 aa  43.9  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.313421  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0961  type IV pilus modification protein PilV  37.5 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.89267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0501  type IV pilus modification protein PilV  27.03 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2719  methylation  32.26 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2953  type IV pilus modification protein PilV  24.83 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.192573  normal  0.254456 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3132  type IV pilus modification protein PilV  34.29 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0488  hypothetical protein  36.92 
 
 		 161 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000470807  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004284  type 4 fimbrial biogenesis protein PilV  31.58 
 
 		 137 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11840  type IV pilus assembly hypothetical protein, PilV-like protein  41.38 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  33.72 
 
 		 177 aa  41.2  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1125  type IV pilus modification protein PilV  34.85 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1103  type IV pilus modification protein PilV  24.12 
 
 		 173 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1160  type IV pilus modification protein PilV  26.35 
 
 		 195 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.574429 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1085  hypothetical protein  24.03 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0970  type IV pilin, putative  24.03 
 
 		 166 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.42279  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1706  type IV pilus modification protein PilV  25.93 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3183  type IV pilus modification protein PilV  25.4 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3174  hypothetical protein  46 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1768  putative type IV pilus assembly protein PilV  25.93 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3528  hypothetical protein  35.71 
 
 		 187 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3231  type IV pilus modification protein PilV  35.71 
 
 		 195 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>