18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0989 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0989  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  268  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.670007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2153  hypothetical protein  60.63 
 
 		 135 aa  166  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1806  hypothetical protein  33.06 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1538  hypothetical protein  28.91 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2036  hypothetical protein  35.83 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2822  type IV pilus modification protein PilV  46.3 
 
 		 223 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2677  hypothetical protein  29.6 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3228  Tfp pilus assembly protein PilV-like protein  37.68 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2271  Type IV fimbrial biogenesis protein PilV  30.77 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0867  type IV pilus modification protein PilV  31.87 
 
 		 177 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00712578  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0812  hypothetical protein  25 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2343  hypothetical protein  25.49 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29323  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0393  MshA pilin protein MshD  35 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000144635  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5183  type IV pilus modification protein PilV  37.88 
 
 		 200 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0958149  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1379  type IV pilus modification protein PilV  28.69 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.29272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0675  hypothetical protein  37.29 
 
 		 195 aa  40  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2673  hypothetical protein  24.72 
 
 		 116 aa  40  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  23.97 
 
 		 185 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>