33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0886 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0886  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 283 aa  567  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.115142 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3265  type II secretory pathway pseudopilin PulG  44.8 
 
 		 287 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0394  type II secretory pathway pseudopilin PulG  45.68 
 
 		 268 aa  185  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0757  hypothetical protein  41.05 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.538658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3339  methylation  38.36 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.510017  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3104  hypothetical protein  37.2 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4102  MSHA biogenesis protein MshO  32.16 
 
 		 282 aa  95.5  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0476  methylation site containing protein  30.67 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0553768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3475  methylation site containing protein  30.33 
 
 		 287 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3651  methylation site containing protein  30.38 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1144  MSHA biogenesis protein MshO  31.65 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3757  methylation site containing protein  31.96 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0400  methylation site containing protein  30.96 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.642203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3337  MSHA biogenesis protein MshO precursor  29.72 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.131781  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0519  MSHA biogenesis protein MshO  28.47 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3825  MSHA biogenesis protein MshO  28.67 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0143391  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0494  MSHA biogenesis protein MshO  28.82 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709841  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0571  MSHA biogenesis protein MshO  31.01 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0515  MSHA biogenesis protein MshO  30.54 
 
 		 290 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.141751  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4566  putative MSHA biogenesis protein MshO  30.21 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0180  prepilin-type cleavage/methylation  28.87 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0555  methylation site containing protein  25.09 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0166475  normal  0.583012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4405  methylation site containing protein  26.16 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2830  hypothetical protein  34.65 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.496531  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00261  Tfp pilus assembly protein PilW  27.21 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03688  hypothetical protein  26.52 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3741  methylation site containing protein  27.4 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.772407  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0763  hypothetical protein  25.6 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0696342  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0464  MSHA biogenesis protein MshO precursor  26.22 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.467537  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002380  MSHA biogenesis protein MshO  34.44 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.197407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  29.29 
 
 		 169 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2111  putative pilin, type IV  54.55 
 
 		 159 aa  42.7  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.601836 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1414  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1292 aa  42  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>