35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03688 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03688  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  493  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002380  MSHA biogenesis protein MshO  48.82 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.197407  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0480  exported protein MshO  34.5 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.772217  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0494  MSHA biogenesis protein MshO  30.26 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709841  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3825  MSHA biogenesis protein MshO  30.26 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0143391  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0519  MSHA biogenesis protein MshO  30.4 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0571  MSHA biogenesis protein MshO  28.52 
 
 		 281 aa  99  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0555  methylation site containing protein  29.06 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0166475  normal  0.583012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0400  methylation site containing protein  28.04 
 
 		 265 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.642203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3757  methylation site containing protein  27.76 
 
 		 295 aa  92.8  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0511874  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4102  MSHA biogenesis protein MshO  27.34 
 
 		 282 aa  91.3  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4405  methylation site containing protein  27.8 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3475  methylation site containing protein  28.36 
 
 		 287 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3651  methylation site containing protein  28.62 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0476  methylation site containing protein  27.64 
 
 		 287 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0553768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4566  putative MSHA biogenesis protein MshO  28.1 
 
 		 292 aa  89  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0515  MSHA biogenesis protein MshO  28.57 
 
 		 290 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.141751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0180  prepilin-type cleavage/methylation  25.45 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3741  methylation site containing protein  29.2 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.772407  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3337  MSHA biogenesis protein MshO precursor  25 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.131781  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2830  hypothetical protein  41.58 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.496531  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00261  Tfp pilus assembly protein PilW  26.07 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3104  hypothetical protein  34.07 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0464  MSHA biogenesis protein MshO precursor  21.3 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.467537  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3339  methylation  33.7 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.510017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0763  hypothetical protein  24.81 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0696342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1144  MSHA biogenesis protein MshO  25.48 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3265  type II secretory pathway pseudopilin PulG  24.34 
 
 		 287 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0886  general secretion pathway protein H  26.52 
 
 		 283 aa  49.3  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.115142 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0757  hypothetical protein  23.33 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.538658  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0813  hypothetical protein  34.62 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0717  type IV pilus assembly protein PilW  34.62 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2822  type IV pilus modification protein PilV  36.67 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.402085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0394  type II secretory pathway pseudopilin PulG  24.23 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0726  hypothetical protein  24.24 
 
 		 328 aa  42.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>