26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0757 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0757  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  520  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.538658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0394  type II secretory pathway pseudopilin PulG  48.08 
 
 		 268 aa  201  8e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3339  methylation  40 
 
 		 283 aa  182  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.510017  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3265  type II secretory pathway pseudopilin PulG  40.15 
 
 		 287 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0886  general secretion pathway protein H  41.05 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.115142 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3104  hypothetical protein  37.62 
 
 		 297 aa  139  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0555  methylation site containing protein  24.56 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0166475  normal  0.583012 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1144  MSHA biogenesis protein MshO  25.94 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0400  methylation site containing protein  23.84 
 
 		 265 aa  62  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.642203  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4566  putative MSHA biogenesis protein MshO  26.6 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.842341  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4405  methylation site containing protein  25.82 
 
 		 277 aa  52.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0180  prepilin-type cleavage/methylation  23.19 
 
 		 280 aa  52.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002380  MSHA biogenesis protein MshO  29.63 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.197407  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0763  hypothetical protein  24.45 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0696342  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00261  Tfp pilus assembly protein PilW  27.87 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03688  hypothetical protein  23.33 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3825  MSHA biogenesis protein MshO  27.27 
 
 		 282 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0143391  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0476  methylation site containing protein  26.57 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0553768  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4102  MSHA biogenesis protein MshO  25 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0515  MSHA biogenesis protein MshO  26.21 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.141751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3651  methylation site containing protein  25.24 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0519  MSHA biogenesis protein MshO  27.18 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0494  MSHA biogenesis protein MshO  25.96 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709841  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3475  methylation site containing protein  25.6 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2830  hypothetical protein  31.11 
 
 		 192 aa  42.7  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.496531  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  36.36 
 
 		 172 aa  42  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>