193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1864 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  100 
 
 		 172 aa  351  2.9999999999999997e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0219  putative type IV pilin  29.95 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  27.75 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2929  general secretion pathway protein H  29.88 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004287  type 4 fimbrial biogenesis protein FimT  27.84 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  29.67 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  49.15 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  36.63 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0385  putative type IV pilin  29.82 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01137  Tfp pilus assembly protein FimT  35.71 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  47.3 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  40 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  30.77 
 
 		 177 aa  64.3  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03018  hypothetical protein  27.71 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  41.25 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3167  hypothetical protein  27.59 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  45.95 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  33.7 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0400  N-terminal methylation site  48.24 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.58 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  36.62 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  31.71 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  27.98 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  26.9 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  27.98 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  39.68 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  42.65 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  35.8 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3553  hypothetical protein  25.49 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  40.26 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  40 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  39.29 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  39.68 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  32.93 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  30.67 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  36.84 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  40.68 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  40.32 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  36.9 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  38.24 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3385  type IV pilin protein, putative  38.57 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  31.25 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  31.25 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  39.13 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  31.25 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2905  Tfp pilus assembly protein FimT  34.43 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  27.43 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2534  N-terminal methylation site-containing protein  50 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  33.78 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3194  hypothetical protein  22.09 
 
 		 163 aa  52.4  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.697618  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3820  hypothetical protein  25 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  normal  0.266235 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  35 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2344  hypothetical protein  36.49 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  31.65 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  43.4 
 
 		 178 aa  52  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0962  N-terminal methylation  36.36 
 
 		 189 aa  52  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  37.84 
 
 		 166 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  40.26 
 
 		 145 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  37.5 
 
 		 186 aa  51.2  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1056  hypothetical protein  33.71 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  40.26 
 
 		 145 aa  50.8  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  51.16 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  36.49 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  41.89 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.91 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  40.54 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  27.27 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  27.27 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  27.27 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  29.63 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  33 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2940  fimbrial biogenesis protein  28.22 
 
 		 176 aa  48.5  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.07 
 
 		 194 aa  48.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.78 
 
 		 168 aa  48.1  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  26.77 
 
 		 163 aa  48.1  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3268  hypothetical protein  28.05 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0660732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  31.08 
 
 		 171 aa  47.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.05 
 
 		 169 aa  47.4  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  38.33 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  34.29 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  42.11 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  46.55 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0646  hypothetical protein  39.29 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2572  putative type IV pilin  26.23 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2274  prepilin peptidase dependent protein A precursor  25 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1601  type 4 pilin  34.57 
 
 		 162 aa  47  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  38.89 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  39.29 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  26.52 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2535  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.38 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  39.06 
 
 		 111 aa  45.8  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0267  hypothetical protein  37.5 
 
 		 225 aa  45.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  36.36 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.85 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0777  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  27.27 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  35 
 
 		 192 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  32.43 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1204  methylation site containing protein  33.72 
 
 		 162 aa  45.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  40.74 
 
 		 191 aa  45.1  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>