36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3820 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3820  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  345  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  normal  0.266235 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1037  hypothetical protein  54.49 
 
 		 189 aa  169  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0985  hypothetical protein  54.49 
 
 		 189 aa  169  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.323968  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3194  hypothetical protein  50.64 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.697618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3237  hypothetical protein  52.17 
 
 		 139 aa  143  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.680138  normal  0.470977 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3013  hypothetical protein  44.23 
 
 		 163 aa  140  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3395  hypothetical protein  50.62 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114024  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0908  hypothetical protein  46.88 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4091  hypothetical protein  39.22 
 
 		 156 aa  105  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0320835  normal  0.410981 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0865  conserved hypothetical protein  38.56 
 
 		 156 aa  104  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3036  hypothetical protein  38.56 
 
 		 156 aa  104  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714843  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2972  hypothetical protein  38.56 
 
 		 156 aa  104  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3146  hypothetical protein  38.56 
 
 		 156 aa  104  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277035  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2973  hypothetical protein  38.56 
 
 		 156 aa  104  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237363  decreased coverage  0.00343665 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0889  hypothetical protein  38.56 
 
 		 156 aa  104  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02674  hypothetical protein  38.56 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.164339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02635  hypothetical protein  38.56 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.155968  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3326  hypothetical protein  41.77 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0233532 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3146  hypothetical protein  41.77 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3226  hypothetical protein  41.77 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0150572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3212  hypothetical protein  41.77 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3163  hypothetical protein  40.99 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3268  hypothetical protein  35.62 
 
 		 154 aa  85.5  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0660732  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  29.45 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  25 
 
 		 172 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0679  type IV pilin  24.85 
 
 		 181 aa  52  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.639618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3553  hypothetical protein  31.03 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  23.43 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  27.56 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  26.77 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  26.77 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  27.01 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3167  hypothetical protein  25.66 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  44.26 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  35.21 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1537  hypothetical protein  28.05 
 
 		 161 aa  41.6  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>