52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3268 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3268  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  318  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0660732  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3146  hypothetical protein  57.14 
 
 
156 aa  183  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277035  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0865  conserved hypothetical protein  57.14 
 
 
156 aa  183  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2972  hypothetical protein  57.14 
 
 
156 aa  183  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0889  hypothetical protein  57.14 
 
 
156 aa  183  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2973  hypothetical protein  57.14 
 
 
156 aa  183  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237363  decreased coverage  0.00343665 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3036  hypothetical protein  57.14 
 
 
156 aa  183  7e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714843  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02674  hypothetical protein  57.14 
 
 
156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.164339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02635  hypothetical protein  57.14 
 
 
156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.155968  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4091  hypothetical protein  56.46 
 
 
156 aa  180  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0320835  normal  0.410981 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3163  hypothetical protein  55.77 
 
 
156 aa  156  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228007  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3212  hypothetical protein  55.77 
 
 
156 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3226  hypothetical protein  55.77 
 
 
156 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0150572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3146  hypothetical protein  55.77 
 
 
156 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3326  hypothetical protein  55.77 
 
 
156 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0233532 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3820  hypothetical protein  35.62 
 
 
169 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  normal  0.266235 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0985  hypothetical protein  31.51 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.323968  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1037  hypothetical protein  31.51 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3194  hypothetical protein  27.52 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.697618  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3395  hypothetical protein  32.9 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114024  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0908  hypothetical protein  32.26 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3013  hypothetical protein  32.68 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3237  hypothetical protein  31.67 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.680138  normal  0.470977 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  28.05 
 
 
172 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3575  putative major pilin subunit  48.72 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2019  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.49 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  26.92 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  25.66 
 
 
196 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  25.66 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  46.15 
 
 
145 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  46.15 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  46.15 
 
 
145 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  46.15 
 
 
145 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  46.15 
 
 
145 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  36.54 
 
 
168 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  33.78 
 
 
171 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  46.15 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  46.15 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  46.15 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  46.15 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  46.15 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  46.15 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  46.15 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  28.79 
 
 
138 aa  41.2  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  41.46 
 
 
179 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3498  putative major pilin subunit  47.22 
 
 
154 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3370  putative major pilin subunit  47.22 
 
 
154 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.981789  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1041  putative major pilin subunit  47.22 
 
 
154 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.131052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  30.56 
 
 
144 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  30.56 
 
 
144 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  43.59 
 
 
145 aa  40.4  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  31.88 
 
 
177 aa  40.4  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>