35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0908 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0908  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  342  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3395  hypothetical protein  86.23 
 
 		 167 aa  280  6.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114024  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3194  hypothetical protein  50.3 
 
 		 163 aa  174  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.697618  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3013  hypothetical protein  46.71 
 
 		 163 aa  154  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3820  hypothetical protein  46.25 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  normal  0.266235 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0865  conserved hypothetical protein  38.06 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4091  hypothetical protein  38.06 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0320835  normal  0.410981 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3036  hypothetical protein  38.06 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714843  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2973  hypothetical protein  38.06 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237363  decreased coverage  0.00343665 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0889  hypothetical protein  38.06 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3146  hypothetical protein  38.06 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277035  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2972  hypothetical protein  38.06 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02635  hypothetical protein  38.06 
 
 		 156 aa  121  6e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.155968  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02674  hypothetical protein  38.06 
 
 		 156 aa  121  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.164339  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1037  hypothetical protein  39.39 
 
 		 189 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0985  hypothetical protein  39.39 
 
 		 189 aa  107  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.323968  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3326  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0233532 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3146  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3212  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3226  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0150572 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3163  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3268  hypothetical protein  32.26 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0660732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3237  hypothetical protein  37.32 
 
 		 139 aa  84.7  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.680138  normal  0.470977 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0679  type IV pilin  26.59 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.639618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  39.44 
 
 		 232 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  33.33 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0157  putative major pilin subunit  32.81 
 
 		 145 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0156  putative major pilin subunit  32.81 
 
 		 145 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0164  putative major pilin subunit  32.81 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268979  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  32.81 
 
 		 145 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  32.47 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  32.81 
 
 		 145 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3553  hypothetical protein  40.82 
 
 		 171 aa  40.8  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  26.4 
 
 		 199 aa  40.8  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  26.39 
 
 		 188 aa  40.8  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>