37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3194 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3194  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  336  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.697618  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3013  hypothetical protein  55.83 
 
 		 163 aa  189  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3395  hypothetical protein  51.5 
 
 		 167 aa  160  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114024  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3820  hypothetical protein  50.64 
 
 		 169 aa  159  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  normal  0.266235 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0908  hypothetical protein  50.3 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.760185  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1037  hypothetical protein  46.2 
 
 		 189 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0985  hypothetical protein  46.2 
 
 		 189 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.323968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3237  hypothetical protein  44.6 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.680138  normal  0.470977 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3212  hypothetical protein  36.05 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3226  hypothetical protein  36.05 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0150572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3146  hypothetical protein  36.05 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3326  hypothetical protein  36.05 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0233532 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3163  hypothetical protein  35.37 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3036  hypothetical protein  31.54 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.714843  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2973  hypothetical protein  31.54 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237363  decreased coverage  0.00343665 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0889  hypothetical protein  31.54 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0865  conserved hypothetical protein  31.54 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3146  hypothetical protein  31.54 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277035  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2972  hypothetical protein  31.54 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02674  hypothetical protein  30.87 
 
 		 156 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.164339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02635  hypothetical protein  30.87 
 
 		 156 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.155968  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4091  hypothetical protein  30.87 
 
 		 156 aa  84  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0320835  normal  0.410981 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3268  hypothetical protein  27.52 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0660732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0679  type IV pilin  27.06 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.639618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  22.09 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0385  putative type IV pilin  23.12 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3167  hypothetical protein  29.08 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0657  hypothetical protein  30.07 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.385115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  24.36 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  27.88 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  22.49 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  30.53 
 
 		 201 aa  42.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1722  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  24.79 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4154  hypothetical protein  35.59 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0653  general secretion pathway protein H  36.96 
 
 		 182 aa  40.4  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0219082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0674  general secretion pathway protein H  36.96 
 
 		 182 aa  40.4  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0856392  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  25 
 
 		 166 aa  40.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>