More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0714 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  100 
 
 		 166 aa  332  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  79.39 
 
 		 166 aa  266  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  43.53 
 
 		 184 aa  141  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  36.36 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4555  type IV pili biogenesis protein FimT  31.36 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.691315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  31.33 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.95 
 
 		 194 aa  73.9  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0607  type IV pili biogenesis protein FimT, putative  32.34 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0648  hypothetical protein  32.93 
 
 		 160 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  29.63 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  38.2 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  31.87 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  31.82 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  31.87 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  26.19 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.22 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  48.53 
 
 		 144 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  47.06 
 
 		 144 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  47.06 
 
 		 144 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  45.33 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  32.93 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  29.52 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.99 
 
 		 194 aa  64.3  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  28.41 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.29 
 
 		 181 aa  64.3  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  30.41 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1821  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  31.71 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.071899  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0653  type IV pili biogenesis protein FimT  28.48 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.679722  normal  0.506575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  28.09 
 
 		 187 aa  62  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.57 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.09 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  40.51 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  32.14 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  32.52 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  34.09 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  46.27 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  27.84 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.94 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  38.27 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  29.08 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  39 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.53 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  28.48 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.74 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  37.97 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  37.97 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  33.73 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  37.84 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  26.29 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  46.77 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03016  putative type IV pilus biogenesis protein  29.86 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.155595  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  35.56 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  26.05 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  29.01 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  37.37 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  29.75 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  45.9 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  26.29 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  30.36 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  50 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  28.4 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.48 
 
 		 170 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0485  methylation  33.87 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.88 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  30.83 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.88 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  43.55 
 
 		 192 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  30.92 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0400  N-terminal methylation site  30.97 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  25.88 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0665  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  27.32 
 
 		 190 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.956301  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.09 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.391633 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  27.95 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  27.95 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  39.06 
 
 		 177 aa  51.2  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.4 
 
 		 169 aa  50.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  35.35 
 
 		 186 aa  50.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  35.29 
 
 		 188 aa  50.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.41 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  36.49 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  46.55 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  34.44 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  52.54 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  27.95 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  39.34 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  30.16 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0709  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  25.97 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.51 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  40.98 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  28.32 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.05 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  34.58 
 
 		 186 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0385  putative type IV pilin  25.95 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.59 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.59 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  30.59 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004287  type 4 fimbrial biogenesis protein FimT  34.18 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  34.52 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  45.1 
 
 		 141 aa  48.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3229  Tfp pilus assembly protein  35.06 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>