165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1094 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  100 
 
 		 170 aa  350  5e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  56.71 
 
 		 169 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.391633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  56.1 
 
 		 169 aa  201  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  52.94 
 
 		 170 aa  198  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  54.12 
 
 		 170 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  53.57 
 
 		 170 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  52.94 
 
 		 170 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  51.76 
 
 		 170 aa  194  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  51.18 
 
 		 170 aa  191  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  51.19 
 
 		 170 aa  185  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  48.52 
 
 		 170 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  48.52 
 
 		 170 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  48.52 
 
 		 170 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  48.52 
 
 		 170 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  48.5 
 
 		 173 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  50 
 
 		 177 aa  163  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  47.9 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1068  type IV pilus biogenesis protein, putative  52.24 
 
 		 151 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.537139  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  37.28 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  37.36 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  41.21 
 
 		 163 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  38.15 
 
 		 163 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.99 
 
 		 164 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.99 
 
 		 164 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.99 
 
 		 164 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  35.54 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.22 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  37.35 
 
 		 208 aa  103  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  37.04 
 
 		 160 aa  103  9e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  37.04 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  37.21 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  34.57 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1219  putative type IV pilus biogenesis protein  33.33 
 
 		 180 aa  93.6  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1204  methylation site containing protein  40.54 
 
 		 162 aa  84.3  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.57 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  30.12 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  28.25 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  27.81 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  31.36 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  30.3 
 
 		 206 aa  67  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  30.77 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03016  putative type IV pilus biogenesis protein  28.09 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.155595  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  29.82 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  32.74 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  27.27 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  28.14 
 
 		 195 aa  63.9  0.0000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4847  hypothetical protein  36.96 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  33.7 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  29.48 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  28.02 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.78 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  28.4 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  26.16 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  25.42 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  26.74 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  38.04 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  31.95 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1821  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  29.63 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.071899  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  28.66 
 
 		 192 aa  57.4  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  35.42 
 
 		 214 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  45.07 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  30.12 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3169  prepilin-type cleavage/methylation  27.54 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  24.58 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0378  hypothetical protein  26.7 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913387  hitchhiker  0.000267093 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  33.71 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  31.67 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  38.3 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1381  hypothetical protein  37.88 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722593  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0562  putative fimT protein  27.86 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000705405  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  32.56 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  28 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  31.15 
 
 		 201 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  34.38 
 
 		 214 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  31.48 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2579  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  36.11 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.37 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  37.1 
 
 		 186 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  36.36 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0702  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  37.1 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0023  pre-pilin like leader sequence  32.74 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5189  type 4 fimbrial biogenesis protein FimT  26.81 
 
 		 169 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1621  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  27.95 
 
 		 186 aa  51.2  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000506995  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  30.77 
 
 		 186 aa  50.8  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  27.16 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  30.77 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0188  pilus assembly protein  30.51 
 
 		 222 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.323266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  31.71 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  25.28 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  37.31 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0337  hypothetical protein  26.9 
 
 		 195 aa  48.5  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0256489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  41.51 
 
 		 199 aa  48.5  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  40.35 
 
 		 161 aa  47.8  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  36.47 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2665  methylation  32.56 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  27.27 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  35.21 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4848  general secretion pathway protein H  25.58 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  39.44 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2965  Tfp pilus assembly protein FimT  24.54 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.108298 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>