156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0233 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  100 
 
 		 152 aa  297  4e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  58.67 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  41.43 
 
 		 199 aa  64.3  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  52.73 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  28.37 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  42.65 
 
 		 170 aa  57  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  26.67 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  48.39 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  33.73 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0714  type IV pilus biogenesis protein  35.56 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  29.2 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  29.45 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  28.07 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  40.28 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.38 
 
 		 187 aa  53.9  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  36.92 
 
 		 194 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  43.08 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  35.35 
 
 		 174 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  37.5 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  26.85 
 
 		 192 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  26.85 
 
 		 192 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  38.18 
 
 		 177 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  40.68 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  42.62 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  45.16 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  39.62 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  38.46 
 
 		 203 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004287  type 4 fimbrial biogenesis protein FimT  34.85 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  44.26 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0857  general secretion pathway protein H  32.45 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2552  hypothetical protein  30.68 
 
 		 185 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  42.86 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2905  Tfp pilus assembly protein FimT  32.89 
 
 		 212 aa  51.2  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  32.39 
 
 		 173 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.63 
 
 		 181 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  43.08 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  37.14 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  38.1 
 
 		 188 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  37.1 
 
 		 188 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  30.19 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  41.18 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  46.77 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01137  Tfp pilus assembly protein FimT  32.2 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0337  hypothetical protein  47.06 
 
 		 195 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0256489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  38.71 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  28.67 
 
 		 192 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  32.5 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  33.83 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  33.75 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2664  fimbrial biogenesis protein  34.92 
 
 		 178 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470161  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2929  general secretion pathway protein H  30 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  32.5 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0400  N-terminal methylation site  40 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  32.5 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  46.67 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  29.41 
 
 		 214 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.7 
 
 		 164 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.7 
 
 		 164 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  33.82 
 
 		 162 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3385  type IV pilin protein, putative  31.06 
 
 		 172 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.7 
 
 		 164 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  41.27 
 
 		 191 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  24.67 
 
 		 182 aa  45.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4847  hypothetical protein  36.36 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  25.53 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  25.53 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  41.82 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0385  putative type IV pilin  33.33 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0962  N-terminal methylation  33.96 
 
 		 189 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1541  hypothetical protein  28.38 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1166  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.03 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  36.51 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  32.81 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  35.94 
 
 		 200 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  34.92 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1736  hypothetical protein  28.09 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  31.87 
 
 		 214 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  41.38 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  41.38 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1711  type 4 prepilin-like protein  28.09 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2881  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  48.21 
 
 		 204 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  34.78 
 
 		 206 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3553  hypothetical protein  25 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  29.2 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  37.74 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0257  general secretion pathway protein G  43.64 
 
 		 193 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0371  pilus assembly protein FimT-like  48.53 
 
 		 195 aa  44.3  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0210439  normal  0.0271791 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  31.15 
 
 		 177 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1601  type 4 pilin  31.25 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1204  methylation site containing protein  31.54 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  37.1 
 
 		 170 aa  43.9  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  37.25 
 
 		 166 aa  43.9  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.39 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  31.25 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.24 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2674  hypothetical protein  31.15 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000300663 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03016  putative type IV pilus biogenesis protein  26.03 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.155595  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5685  Type IV pilus transmembrane protein, FimT  45.61 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.695953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  28.57 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  39.62 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>