76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0337 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0337  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  409  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0256489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0371  pilus assembly protein FimT-like  87.69 
 
 		 195 aa  342  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0210439  normal  0.0271791 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0378  hypothetical protein  47.13 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913387  hitchhiker  0.000267093 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  35.29 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  47.06 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2946  methylation site containing protein  31.06 
 
 		 170 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.105075  normal  0.412318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3028  methylation site containing protein  31.06 
 
 		 170 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.811666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3125  methylation site containing protein  31.06 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.9 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  25.62 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  25.47 
 
 		 170 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  27.75 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1070  methylation site containing protein  26.22 
 
 		 170 aa  52.8  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.54 
 
 		 173 aa  51.6  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  29.24 
 
 		 170 aa  51.2  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  25.98 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.62 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2712  type IV pilus biogenesis protein, putative  28.57 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000750453  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3919  putative type IV pilus biogenesis protein  23.78 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159309  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.01 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  26.71 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1205  type IV pilus biogenesis protein, putative  24.71 
 
 		 169 aa  48.5  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  29.51 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  30.99 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1132  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.47 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0670  hypothetical protein  33.85 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.177225  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.33 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3224  type IV pilus biogenesis protein, putative  27.33 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  35.14 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.97 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1167  type IV pilus biogenesis protein, putative  26.67 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.350797 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2880  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  26.16 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  35.29 
 
 		 155 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  30.67 
 
 		 145 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  30 
 
 		 191 aa  45.1  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  29.41 
 
 		 175 aa  45.1  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  34.92 
 
 		 151 aa  44.7  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  34.85 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  35.29 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004287  type 4 fimbrial biogenesis protein FimT  36.07 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  30.67 
 
 		 145 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  28.12 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0385  putative type IV pilin  26.14 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  30.56 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  33.33 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  30.99 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  33.33 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  44.07 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  28.42 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  30 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  30 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  21.76 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  29.67 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1302  type IV pilus biogenesis protein, putative  23.21 
 
 		 169 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.391633 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  29.67 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.37 
 
 		 121 aa  42.7  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  32.39 
 
 		 186 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1834  fimbrial biogenesis protein  24.09 
 
 		 195 aa  42  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.723988  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  21.89 
 
 		 172 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  32.31 
 
 		 150 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  32.31 
 
 		 150 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  34.38 
 
 		 162 aa  42  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  32.31 
 
 		 150 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  32.31 
 
 		 150 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  32.31 
 
 		 150 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  45.24 
 
 		 161 aa  42  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  32.31 
 
 		 150 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  29.33 
 
 		 145 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  29.11 
 
 		 174 aa  41.6  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2153  competence protein  37.31 
 
 		 148 aa  41.6  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0605499  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1895  type 4 fimbrial biogenesis protein  23.91 
 
 		 195 aa  41.2  0.009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  32.31 
 
 		 150 aa  41.2  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  26.77 
 
 		 218 aa  41.2  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3520  type IV pilus biogenesis protein, putative  23.49 
 
 		 170 aa  41.2  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  31.67 
 
 		 158 aa  41.2  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>