234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3885 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  327  5.0000000000000004e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  61.18 
 
 		 157 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  58.55 
 
 		 168 aa  191  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  57.69 
 
 		 158 aa  191  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  60.78 
 
 		 159 aa  187  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  55.06 
 
 		 170 aa  179  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  54.66 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  54.25 
 
 		 160 aa  174  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  53.25 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1988  hypothetical protein  52.29 
 
 		 157 aa  167  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0923651  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4705  putative secretion type II protein  52.9 
 
 		 176 aa  164  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2460  secretion type II protein  54.04 
 
 		 159 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1335  methylation  50.31 
 
 		 161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0885873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2294  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  53.42 
 
 		 159 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.797755  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3477  hypothetical protein  53.42 
 
 		 159 aa  160  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103302  normal  0.864591 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2620  putative general secretion pathway GspG related transmembrane protein  56.86 
 
 		 159 aa  157  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2469  G protein signal peptide-like secretion type II protein  52.94 
 
 		 157 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354384  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_003296  RS00349  putative general secretion pathway GSPG-related transmembrane protein  47.83 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1439  general secretion pathway GspG related transmembrane protein  51.23 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0119159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  45.45 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  45.57 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  42.77 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  40.74 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2414  general secretion pathway protein G  48.12 
 
 		 164 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  41.33 
 
 		 140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1285  hypothetical protein  45.28 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2998  hypothetical protein  45.28 
 
 		 164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000440497 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  40.36 
 
 		 161 aa  100  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1461  hypothetical protein  42.5 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  36.54 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  33.55 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  32.48 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  30.92 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  32.28 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  38.71 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  32.3 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  32.03 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  34.87 
 
 		 122 aa  67  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  30.99 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  32.89 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  32.24 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  26.75 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  34.78 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  30.43 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  34.21 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  33.74 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  30 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  33.77 
 
 		 124 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  50 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  35.66 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  31.58 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  31.82 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  31.82 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  45.45 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  33.55 
 
 		 184 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  38.89 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  31.17 
 
 		 124 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  30.92 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  37.5 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0728  hypothetical protein  42.47 
 
 		 174 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  40.85 
 
 		 187 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2826  Tfp pilus assembly protein  36.59 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621265 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  28.81 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  31.47 
 
 		 130 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0727  hypothetical protein  46.15 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  34.41 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  30.97 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  38.6 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.14 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  25.52 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  27.39 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  26.8 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  49.02 
 
 		 199 aa  48.5  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  33.67 
 
 		 548 aa  48.5  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  46.94 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0692  hypothetical protein  42.65 
 
 		 173 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  43.4 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  29.17 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.66 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  26.89 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  34.29 
 
 		 145 aa  47.8  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  29.82 
 
 		 144 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  42.59 
 
 		 139 aa  47.4  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  28.83 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  27.63 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.31 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  26.67 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  26.67 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  29.27 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.45 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  47.06 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  41.07 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  34.33 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  36.84 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  26.67 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.73 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  28.07 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  26.67 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  43.14 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>