More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_29080 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  100 
 
 
124 aa  247  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  79.03 
 
 
128 aa  205  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  79.03 
 
 
124 aa  204  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  78.23 
 
 
124 aa  203  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  77.42 
 
 
124 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  70.16 
 
 
124 aa  191  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  72.58 
 
 
129 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  64.17 
 
 
138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  57.94 
 
 
126 aa  159  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  61.9 
 
 
126 aa  158  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  59.17 
 
 
133 aa  154  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  54.55 
 
 
122 aa  141  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  55.56 
 
 
129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  55.46 
 
 
128 aa  138  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  57.02 
 
 
124 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  50.41 
 
 
131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  53.33 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  42.96 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  42.11 
 
 
140 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  44.09 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  51.92 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  47.5 
 
 
184 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  42.4 
 
 
137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  42.64 
 
 
135 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  40.5 
 
 
121 aa  102  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  40.94 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  39.37 
 
 
131 aa  97.1  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  37.24 
 
 
149 aa  97.1  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  44.19 
 
 
135 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4795  putative general (Type II) secretion pathway protein  37.31 
 
 
223 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  39.33 
 
 
142 aa  67.4  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  34.21 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  36.08 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  36.08 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  39.33 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  45.57 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.27 
 
 
157 aa  63.5  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  32.48 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  36.59 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  33.08 
 
 
154 aa  62  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  44.16 
 
 
209 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  32.14 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  33.74 
 
 
161 aa  61.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  32.31 
 
 
158 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  30.97 
 
 
177 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  37.68 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  29.11 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  32.31 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.78 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  47.69 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  36.63 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  40.21 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  28.78 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.97 
 
 
121 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  39.56 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  32.37 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  44.78 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  32.05 
 
 
172 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  39.53 
 
 
144 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  28.78 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  28.78 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  28.78 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  32.48 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  34.69 
 
 
148 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  42.03 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  38.74 
 
 
172 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  37.5 
 
 
170 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  33.97 
 
 
161 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  40 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  29.5 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  31.54 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  30.77 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  41.18 
 
 
145 aa  57  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  30.77 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  30.77 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 
150 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  30.7 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 
150 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  30.77 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 
150 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 
150 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  27.11 
 
 
164 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.78 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.79 
 
 
152 aa  57  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.29 
 
 
165 aa  57  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1170  xcmT3  38.46 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  34.65 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  34.72 
 
 
162 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3564  general secretion pathway protein G  30 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.78 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  33.12 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  36.76 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  41.54 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  31.88 
 
 
144 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>