151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4705 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4705  putative secretion type II protein  100 
 
 		 176 aa  355  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420147  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  69.62 
 
 		 172 aa  222  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  56.41 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  57.14 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  54.84 
 
 		 172 aa  167  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  53.9 
 
 		 158 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  52.9 
 
 		 161 aa  164  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  54.04 
 
 		 159 aa  163  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  51.61 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  51.27 
 
 		 170 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1988  hypothetical protein  50.32 
 
 		 157 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0923651  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_003296  RS00349  putative general secretion pathway GSPG-related transmembrane protein  47.4 
 
 		 158 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1439  general secretion pathway GspG related transmembrane protein  49.36 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0119159  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2620  putative general secretion pathway GspG related transmembrane protein  50.31 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3477  hypothetical protein  51.28 
 
 		 159 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103302  normal  0.864591 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2294  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  51.28 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.797755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2460  secretion type II protein  51.28 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  42.95 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2469  G protein signal peptide-like secretion type II protein  50.97 
 
 		 157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354384  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1335  methylation  46.1 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0885873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  44.79 
 
 		 163 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  42.33 
 
 		 177 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  37.75 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1285  hypothetical protein  45 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  40.48 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2998  hypothetical protein  43.9 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000440497 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2414  general secretion pathway protein G  42.33 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  42.59 
 
 		 161 aa  95.1  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1461  hypothetical protein  39.39 
 
 		 162 aa  90.5  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  36.31 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  33.75 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  31.06 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  31.41 
 
 		 138 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  32.08 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  34.84 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  30.32 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  32.9 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  29.21 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  29.03 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  27.92 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03959  general secretion pathway protein G  29.71 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  35.21 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0234  general secretion pathway protein G  29.71 
 
 		 146 aa  52  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  33.33 
 
 		 130 aa  50.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0108  general secretion pathway protein G  29.08 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  29.49 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  34.19 
 
 		 124 aa  48.9  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  32.88 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  27.81 
 
 		 121 aa  48.5  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  42.11 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  39.29 
 
 		 136 aa  48.5  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  29.05 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  27.78 
 
 		 150 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  29.68 
 
 		 129 aa  47.8  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  27.78 
 
 		 150 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  27.78 
 
 		 150 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  31.54 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  27.08 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  27.08 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  40.38 
 
 		 142 aa  46.2  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  27.1 
 
 		 124 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0172  general secretion pathway protein G  27.08 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  27.1 
 
 		 126 aa  45.4  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  25.87 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  26.39 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.27 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0147  general secretion pathway protein G  26.81 
 
 		 144 aa  45.1  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  27.27 
 
 		 131 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  38.46 
 
 		 142 aa  44.7  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  35 
 
 		 169 aa  44.7  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  28.47 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  27.39 
 
 		 133 aa  44.3  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  33.33 
 
 		 144 aa  44.3  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  33.33 
 
 		 144 aa  44.3  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4731  general secretion pathway protein G  26.24 
 
 		 144 aa  44.3  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0599807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  28.57 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  25 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  33.33 
 
 		 133 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  28.24 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  32.71 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  28.85 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  27.16 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  28.57 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  34.88 
 
 		 136 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  27.14 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  26.49 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  26.75 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  25.17 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  25 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  26.62 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  25.9 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  43.14 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  27.78 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  29.85 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  27.81 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  27.15 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0200  hypothetical protein  30.77 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000191145  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4355  general secretion pathway protein G  26.24 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  26.39 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>