98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2414 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2414  general secretion pathway protein G  100 
 
 
164 aa  333  9e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  63.41 
 
 
164 aa  217  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  59.87 
 
 
177 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  60.51 
 
 
161 aa  198  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1285  hypothetical protein  61.82 
 
 
164 aa  184  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2998  hypothetical protein  61.21 
 
 
164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000440497 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1461  hypothetical protein  62.42 
 
 
162 aa  171  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  50.62 
 
 
163 aa  167  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  53.99 
 
 
161 aa  156  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  42.11 
 
 
140 aa  124  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  48.12 
 
 
161 aa  124  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  45.86 
 
 
157 aa  123  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  46.2 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1988  hypothetical protein  42.68 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0923651  normal  0.190547 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  45.57 
 
 
168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  45.91 
 
 
159 aa  114  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4705  putative secretion type II protein  42.33 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420147  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  40.88 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  43.12 
 
 
172 aa  112  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  42.77 
 
 
160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  40.37 
 
 
170 aa  103  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00349  putative general secretion pathway GSPG-related transmembrane protein  40.38 
 
 
158 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2620  putative general secretion pathway GspG related transmembrane protein  42.95 
 
 
159 aa  101  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2460  secretion type II protein  39.63 
 
 
159 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839329  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2469  G protein signal peptide-like secretion type II protein  40.51 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354384  normal  0.562325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2294  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  40.76 
 
 
159 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.797755  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3477  hypothetical protein  40.76 
 
 
159 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103302  normal  0.864591 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1335  methylation  41.77 
 
 
161 aa  92.8  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0885873  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1439  general secretion pathway GspG related transmembrane protein  38.99 
 
 
160 aa  84.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0119159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  31.95 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  32.74 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  34.38 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  34.19 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  30.97 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  29.56 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  31.41 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  30.23 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  32.91 
 
 
122 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  31.25 
 
 
128 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  31.65 
 
 
149 aa  62.4  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  28.74 
 
 
138 aa  62  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  30.06 
 
 
138 aa  61.2  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  32.93 
 
 
135 aa  60.5  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  28.39 
 
 
126 aa  58.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  28.05 
 
 
128 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  29.3 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  29.68 
 
 
124 aa  54.7  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  28.66 
 
 
124 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  31.17 
 
 
129 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  28.03 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  31.43 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  28.85 
 
 
131 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  27.56 
 
 
124 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  33.33 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  29.3 
 
 
121 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  31.36 
 
 
124 aa  49.7  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  32.71 
 
 
130 aa  48.5  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  34.21 
 
 
338 aa  48.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  31.78 
 
 
184 aa  47.8  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  28.83 
 
 
166 aa  47.8  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  27.19 
 
 
144 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  42.59 
 
 
136 aa  47.4  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0033  protein of unknown function DUF1559  33.33 
 
 
323 aa  47  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3034  protein of unknown function DUF1559  34.48 
 
 
326 aa  47.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1856  hypothetical protein  29.17 
 
 
301 aa  45.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4588  general secretion pathway protein G  30.17 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0032  protein of unknown function DUF1559  35.71 
 
 
323 aa  45.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.98147  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  38.89 
 
 
171 aa  44.7  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4235  protein of unknown function DUF1559  32.14 
 
 
313 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0227549  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  25.33 
 
 
141 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  29.86 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  40.38 
 
 
142 aa  43.9  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0200  hypothetical protein  30.77 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000191145  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2678  protein of unknown function DUF1559  32.73 
 
 
349 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.28415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2840  protein of unknown function DUF1559  30.16 
 
 
348 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1892  protein of unknown function DUF1559  31.58 
 
 
325 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  37.88 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  40.74 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  33.96 
 
 
362 aa  43.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3450  protein of unknown function DUF1559  29.36 
 
 
330 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517501  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  28.81 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  29.36 
 
 
140 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  29.36 
 
 
140 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1361  protein of unknown function DUF1559  32.14 
 
 
324 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  36.99 
 
 
174 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  36.92 
 
 
163 aa  42.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44 
 
 
172 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  28.57 
 
 
138 aa  42  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2452  methylation site containing protein  23.96 
 
 
197 aa  42  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00816638  normal  0.444869 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.47 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2857  general secretion pathway protein G  27.52 
 
 
157 aa  41.6  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  31.58 
 
 
165 aa  41.2  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1415  general secretion pathway protein G  27.52 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  42.59 
 
 
165 aa  40.8  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  26.72 
 
 
153 aa  40.8  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  26.67 
 
 
150 aa  40.8  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0303  type IV pilin  31.94 
 
 
175 aa  40.4  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  25.69 
 
 
150 aa  40.4  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>