More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1441 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  100 
 
 		 129 aa  258  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  70.16 
 
 		 124 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  72.58 
 
 		 124 aa  182  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  67.74 
 
 		 128 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  67.74 
 
 		 124 aa  180  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  66.94 
 
 		 124 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  62.9 
 
 		 124 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  67.23 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  60.83 
 
 		 126 aa  156  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  60.8 
 
 		 126 aa  153  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  56.2 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  58.68 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  62.07 
 
 		 124 aa  144  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  53.85 
 
 		 133 aa  143  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  55.17 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  53.78 
 
 		 130 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  50 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  58.25 
 
 		 184 aa  123  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  44.19 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  56.25 
 
 		 145 aa  121  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  39.1 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  39.73 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  45.16 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  42.97 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  46.77 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  41.73 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  42.64 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4795  putative general (Type II) secretion pathway protein  43.18 
 
 		 223 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  37.19 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  35.17 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0137  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  37.89 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  33.57 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  31.45 
 
 		 161 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  38.2 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  33.99 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  34.62 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  33.12 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  38.2 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  33.13 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  37.12 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  35.26 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  34.81 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  33.81 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  35.26 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  33.11 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2310  putative GSPG-related transmembrane protein  34.75 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  0.125662 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  31.96 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  31.96 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  34.78 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  37.63 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  33.33 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  33.1 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  36.21 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02970  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  33.08 
 
 		 144 aa  62  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  30.43 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  35.53 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  33.55 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2620  putative general secretion pathway GspG related transmembrane protein  35.06 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  32.41 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2303  general secretion pathway protein G  27.86 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4713  general secretion pathway protein G  34.56 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  31.94 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  32.32 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1170  xcmT3  33.82 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  32.32 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  32.32 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  32.32 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3030  general secretion pathway protein G  33.05 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187173  hitchhiker  0.00937307 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  32.32 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  29.08 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2590  general secretion pathway protein G  31.16 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2109  general secretion pathway protein G  33.09 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  32.32 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0102  general secretion pathway protein G  41.1 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.573705  normal  0.0126574 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  32.32 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  29.93 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  29.93 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  29.93 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3244  general secretion pathway protein GspG  31.39 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.948956  normal  0.749494 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3424  general secretion pathway protein G  29.93 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  29.93 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1584  general secretion pathway protein G  39.71 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2613  putative general secretion pathway protein G precursor (PilD-dependent protein pddA)  43.28 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  31.31 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  30.5 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  42.42 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  30.5 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  37.25 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2091  general secretion pathway protein G  39.33 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0177627  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  30.88 
 
 		 164 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2778  general secretion pathway protein G  43.24 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00349  putative general secretion pathway GSPG-related transmembrane protein  33.11 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  33.97 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  30.26 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  37.63 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  41.18 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  36.59 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2414  general secretion pathway protein G  30.43 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0687  hypothetical protein  32.14 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.753224  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>