More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1857 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  100 
 
 		 140 aa  287  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  63.38 
 
 		 153 aa  190  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  63.36 
 
 		 138 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  56.83 
 
 		 135 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1776  pilin domain-containing protein  64.46 
 
 		 121 aa  170  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  59.06 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3311  fimbrial protein pilin  56.12 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1286  type II secretion system protein G  56.83 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0138  putative pilus assembly protein  51.91 
 
 		 149 aa  143  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1441  type II secretion system protein G  39.1 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.000189967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2461  type II secretion system protein G  41.35 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  44.96 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3476  type II secretion system protein G  40.6 
 
 		 128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390478  normal  0.854758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2295  type II secretion system protein G  40.6 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.478951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2470  type II secretion system protein G  39.1 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.335351  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3218  general secretion pathway protein G  43.28 
 
 		 126 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.427151 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2412  methylation  40.31 
 
 		 126 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  43.28 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00348  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  44.7 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  42.97 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1334  methylation  42.19 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.372792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29080  general secretion pathway protein G  42.11 
 
 		 124 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1989  hypothetical protein  39.85 
 
 		 124 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0788365  normal  0.18788 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2621  type II secretion system protein G  44.26 
 
 		 184 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  40.62 
 
 		 129 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  45.61 
 
 		 130 aa  105  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1440  type II secretion system protein G  41.98 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0197781  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1302  type II secretion system protein  41.32 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0879623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4704  Type II secretion system protein G  42.27 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0140964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4795  putative general (Type II) secretion pathway protein  36.03 
 
 		 223 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00349  putative general secretion pathway GSPG-related transmembrane protein  30.97 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02978  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  34.36 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.671308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1301  type II secretion system protein  35.29 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.12689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3217  N-terminal methylation site  33.12 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.280155 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1858  N-terminal methylation  31.93 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.450176 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2413  methylation  32.12 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2582  N-terminal methylation site  32.3 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1777  hypothetical protein  29.94 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00171207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  29.63 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3885  hypothetical protein  32.48 
 
 		 161 aa  70.1  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  38.2 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  35.96 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1678  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  31.06 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2302  GSPG-like signal peptide protein  30.43 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.186261  normal  0.0333639 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29090  general secretion pathway protein G  30.38 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.260708  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  33.66 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  33.66 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4705  putative secretion type II protein  32.08 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2414  general secretion pathway protein G  31.95 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  39.22 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  37.89 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.77 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  33.65 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1930  hypothetical protein  30.41 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000900532  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  42.19 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  45.45 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  49.12 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  37.21 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  33.06 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1998  general secretion pathway protein G  29.86 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.59 
 
 		 168 aa  60.5  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  42.42 
 
 		 133 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1042  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  37.11 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.94 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  40.7 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  29.37 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  40.3 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  43.28 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  33.7 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0159  general secretion pathway protein G  32.35 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0154  general secretion pathway protein G  32.35 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.65 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00346  general secretion pathway GSPG-like transmembrane protein  38.57 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.887338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3312  general secretion pathway protein G  26 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  28.68 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  36.62 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  42.42 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.45 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.91 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0152  general secretion pathway protein G  32.38 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.45 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  39.02 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0169  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0156  general secretion pathway protein G  32.38 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  34.69 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0154  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0006  general secretion pathway protein G  31.06 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0815216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4203  general secretion pathway protein G  32.38 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0156  general secretion pathway protein G  32.38 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  29.91 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  28.47 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.14 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  32.63 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0728  hypothetical protein  33.04 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  32.63 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  40.91 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.39 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>