More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3255 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  286  5.0000000000000004e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  38.19 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  38.67 
 
 		 138 aa  90.5  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  41.73 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  41.73 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  36.55 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  35.86 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  35.44 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  35.92 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  35.21 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0493  methylation  39.26 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0830  methylation site containing protein  41.43 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0853  methylation site containing protein  41.43 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0865  methylation site containing protein  41.43 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5192  fimbrial protein pilin  37.14 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  33.1 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  35.97 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004288  putative fimbrial assembly protein PilE  31.47 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  37.12 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  37.3 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  33.81 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  35.07 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  34.48 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  32.65 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0657  type IV pili biogenesis protein PilE  33.57 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  33.12 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0611  type IV pili biogenesis protein PilE  31.91 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  34.53 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0651  type IV pili biogenesis protein PilE  31.91 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.384502 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3901  putative Tfp pilus assembly protein PilE  34.62 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  34.01 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.57 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  35.77 
 
 		 128 aa  67  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0689  putative Tfp pilus assembly protein PilE  30.71 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.786204  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4551  type IV pili biogenesis protein PilE  33.33 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  32.37 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1661  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  31.91 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.507585  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0520  type IV pilin  31.91 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  32.37 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  44.16 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  28.37 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01325  type IV pilin  32.81 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113469  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2575  putative Tfp pilus assembly protein PilE  37.21 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  32.85 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0706  putative Tfp pilus assembly protein PilE  28.68 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  32.12 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  36.07 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  32.86 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0710  methylation site containing protein  36.3 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  33.8 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3170  prepilin-type cleavage/methylation  28.76 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.647515  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  30.43 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3424  methylation site containing protein  36.57 
 
 		 123 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0854  type IV pilin, putative  37.12 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01136  Tfp pilus assembly protein PilE  30.88 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3312  methylation site containing protein  36.3 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.794951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2826  Tfp pilus assembly protein  36.36 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  30.07 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  40.7 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  30.72 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  30.94 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  44.26 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1931  type II secretion system protein G  47.69 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000053439  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  31.47 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  31.47 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2413  type II secretion system protein G  46.27 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.330838  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  24.68 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  45.9 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  30.15 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0268  putative pilin protein PilE  36.64 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.405094  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.66 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1116  general secretion pathway protein G  31.52 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  37.1 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  59.18 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  31.11 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  29.75 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  39.68 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11830  type IV PilE-like pilus assembly protein  35.14 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  30.56 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0681  type-IV pilin  33.33 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1316  type II secretory pathway protein LspG  33.68 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1313  type II secretory pathway protein LspG  33.68 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  27.74 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0652  putative major pilin subunit  52.83 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1460  type II secretion system protein G  47.62 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52288  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  42.47 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  42.47 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  42.47 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  31 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2839  protein involved in methylation  35.51 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273449  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0664  type-IV pilin  32.69 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  49.09 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.55 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1822  type IV pilin  30.66 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0523524  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  50.94 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  50.94 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  30.25 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  53.19 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  40 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>