More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_11830 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_11830  type IV PilE-like pilus assembly protein  100 
 
 		 131 aa  268  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2839  protein involved in methylation  62.5 
 
 		 136 aa  143  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0273449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2882  methylation  51.88 
 
 		 132 aa  131  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.938712  normal  0.364905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  45.53 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  44.26 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  42.22 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  41.86 
 
 		 130 aa  85.9  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  40.88 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  37.59 
 
 		 134 aa  83.6  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  39.53 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0399  general secretion pathway protein H  45.16 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  35.38 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  38.46 
 
 		 128 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  35.11 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  35.16 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  39.26 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5684  pilus assembly protein PilE  41.54 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.148368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  40.32 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  36.49 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5180  fimbrial protein pilin  38.31 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0088813  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  44.96 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  44.96 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  44.19 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  44.19 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  58.06 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0932  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.22 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1764  type IV pilin  34.96 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.940075  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1702  type IV pilin  34.96 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.135824  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2886  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.39 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308484  normal  0.94282 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  35.66 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3255  hypothetical protein  35.14 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  34.53 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3168  prepilin-type cleavage/methylation  32.54 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  31.51 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  48.33 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  49.25 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  50 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2154  Tfp pilus assembly protein PilE  50 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  33.33 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  31.75 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  31.75 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  44.16 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0220  pilus assembly protein  40 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.168362 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3170  prepilin-type cleavage/methylation  45.45 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.647515  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3524  type IV pilus biogenesis protein PilE  41.22 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0086  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  34.33 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  44.59 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  50 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.09 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  33.33 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  36.64 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2715  methylation  36.43 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0720544  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  36.43 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2826  Tfp pilus assembly protein  32.05 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0621265 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0520  type IV pilin  32.8 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1661  type 4 pili biogenesis protein (prepilin-like protein)  32.8 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.507585  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  35.94 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  38.54 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  42.27 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5192  fimbrial protein pilin  34.68 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.373526  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1287  type 4 fimbrial biogenesis signal peptide protein  40.2 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.54364 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  43.33 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  31.19 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  36.73 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  43.33 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  50 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1999  general secretion pathway protein G  39.02 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0957  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.296711 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  34.58 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  61.36 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  44.44 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  65.79 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  69.44 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  45.9 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  63.16 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  38.96 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  47.46 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  75.76 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1822  type IV pilin  34.91 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0523524  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0239  pilus assembly protein PilE  38.66 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.179125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  37.14 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  62.16 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0268  putative pilin protein PilE  35.94 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.405094  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  56.82 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  49.09 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  68.42 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  36.46 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  72.97 
 
 		 174 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  37.63 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  43.33 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  65.71 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  67.65 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  67.65 
 
 		 169 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.08 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  62.16 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  39.74 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0384  putative pilin  52.17 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3102  fimbrial protein pilin  36.51 
 
 		 148 aa  52  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.193045  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  35.19 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  45.9 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>